Project measure / variable:   Mills1   all_micronucl_M20

ID, description, units MPD:25237   all_micronucl_M20   non-nucleated peripheral blood cells with micronuclei   [%]  at age 20mo  
Data set, strains Mills1   inbred   25 strains     sex: both     age: 87wks
Procedure chromosome instability assessment
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Mills1 - non-nucleated peripheral blood cells with micronuclei at age 20mo



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested23 strains22 strains
Mean of the strain means0.180   % 0.236   %
Median of the strain means0.148   % 0.200   %
SD of the strain means± 0.0886 ± 0.140
Coefficient of variation (CV)0.492 0.592
Min–max range of strain means0.110   –   0.544   % 0.0917   –   0.685   %
Mean sample size per strain5.3   mice 4.3   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.2675 0.2675 269.3074 < 0.0001
strain 17 0.9866 0.058 58.4157 < 0.0001
sex:strain 17 0.5849 0.0344 34.6345 < 0.0001
Residuals 145 0.1441 0.001


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.132 0.0133   6 0.00543 0.101 0.11, 0.15 -0.54
129S1/SvImJ m 0.15 0.02   5 0.00894 0.133 0.13, 0.17 -0.61
A/J f 0.14 0.0   3 0.0 0.0 0.14, 0.14 -0.45
A/J m 0.22 0.01   3 0.00577 0.0455 0.21, 0.23 -0.11
BALB/cByJ f 0.254 0.0336   5 0.015 0.132 0.21, 0.29 0.84
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.147 0.0439   7 0.0166 0.298 0.1, 0.22 -0.37
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.12 0.0141   4 0.00707 0.118 0.11, 0.14 -0.83
BUB/BnJ f 0.18 0.0187   5 0.00837 0.104 0.16, 0.2 0.0
BUB/BnJ m 0.2 0.0   1   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.26
C3H/HeJ f 0.128 0.00957   4 0.00479 0.0751 0.12, 0.14 -0.59
C3H/HeJ m 0.223 0.0242   6 0.00989 0.108 0.2, 0.27 -0.09
C57BL/10J f 0.208 0.0286   5 0.0128 0.138 0.17, 0.24 0.32
C57BL/10J m 0.533 0.0344   6 0.0141 0.0646 0.5, 0.58 2.13
C57BL/6J f 0.17 0.02   6 0.00816 0.118 0.15, 0.2 -0.11
C57BLKS/J m 0.21 0.0   2   0.0 0.0 0.21, 0.21 -0.19
C57BR/cdJ f 0.18 0.0465   6 0.019 0.258 0.12, 0.24 0.0
C57BR/cdJ m 0.372 0.0476   9 0.0159 0.128 0.28, 0.43 0.97
C57L/J f 0.14 0.0141   6 0.00577 0.101 0.12, 0.16 -0.45
C57L/J m 0.195 0.0164   6 0.00671 0.0843 0.17, 0.22 -0.29
CBA/J m 0.115 0.00548   6 0.00224 0.0476 0.11, 0.12 -0.87
DBA/2J f 0.128 0.0147   6 0.00601 0.115 0.11, 0.15 -0.59
DBA/2J m 0.18 0.0294   4 0.0147 0.164 0.15, 0.21 -0.4
FVB/NJ f 0.129 0.0199   6 0.00814 0.155 0.094, 0.15 -0.57
FVB/NJ m 0.174 0.0261   5 0.0117 0.15 0.14, 0.21 -0.44
KK/HlJ f 0.194 0.0237   7 0.00896 0.122 0.16, 0.23 0.16
KK/HlJ m 0.685 0.106   2   0.075 0.155 0.61, 0.76 3.21
LP/J f 0.142 0.0179   5 0.008 0.126 0.12, 0.16 -0.43
LP/J m 0.205 0.0152   6 0.00619 0.074 0.19, 0.23 -0.22
MRL/MpJ f 0.185 0.0212   2   0.015 0.115 0.17, 0.2 0.06
MRL/MpJ m 0.145 0.00707   2   0.005 0.0488 0.14, 0.15 -0.65
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.256 0.0619   5 0.0277 0.242 0.19, 0.34 0.86
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.255 0.106   2   0.075 0.416 0.18, 0.33 0.14
NON/ShiLtJ f 0.193 0.017   7 0.00644 0.0884 0.18, 0.22 0.15
NON/ShiLtJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.26
P/J f 0.148 0.0164   5 0.00735 0.111 0.12, 0.16 -0.36
P/J m 0.35 0.0   1   0.0 0.0 0.35, 0.35 0.82
PL/J f 0.544 0.0716   5 0.032 0.132 0.46, 0.64 4.11
PWD/PhJ f 0.117 0.0137   6 0.00558 0.117 0.1, 0.13 -0.71
PWD/PhJ m 0.181 0.0253   8 0.00895 0.14 0.15, 0.23 -0.39
RIIIS/J f 0.17 0.02   5 0.00894 0.118 0.15, 0.2 -0.11
RIIIS/J m 0.235 0.0288   6 0.0118 0.123 0.21, 0.29 -0.01
SM/J f 0.142 0.068   5 0.0304 0.477 0.092, 0.26 -0.43
SM/J m 0.15 0.0158   5 0.00707 0.105 0.13, 0.17 -0.61
WSB/EiJ f 0.11 0.01   3 0.00577 0.0909 0.1, 0.12 -0.79
WSB/EiJ m 0.0917 0.00889   6 0.00363 0.097 0.075, 0.098 -1.03


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.1317 0.0129 0.1571 0.1062
129S1/SvImJ m 0.15 0.0141 0.1779 0.1221
A/J f 0.14 0.0182 0.176 0.104
A/J m 0.22 0.0182 0.256 0.184
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.1471 0.0119 0.1707 0.1236
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.12 0.0158 0.1511 0.0889
C3H/HeJ f 0.1275 0.0158 0.1586 0.0964
C3H/HeJ m 0.2233 0.0129 0.2488 0.1979
C57BL/10J f 0.208 0.0141 0.2359 0.1801
C57BL/10J m 0.5333 0.0129 0.5588 0.5079
C57BR/cdJ f 0.18 0.0129 0.2054 0.1546
C57BR/cdJ m 0.3722 0.0105 0.393 0.3515
C57L/J f 0.14 0.0129 0.1654 0.1146
C57L/J m 0.195 0.0129 0.2204 0.1696
DBA/2J f 0.1283 0.0129 0.1538 0.1029
DBA/2J m 0.18 0.0158 0.2111 0.1489
FVB/NJ f 0.129 0.0129 0.1544 0.1036
FVB/NJ m 0.174 0.0141 0.2019 0.1461
KK/HlJ f 0.1943 0.0119 0.2178 0.1707
KK/HlJ m 0.685 0.0223 0.7291 0.6409
LP/J f 0.142 0.0141 0.1699 0.1141
LP/J m 0.205 0.0129 0.2304 0.1796
MRL/MpJ f 0.185 0.0223 0.2291 0.1409
MRL/MpJ m 0.145 0.0223 0.1891 0.1009
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.256 0.0141 0.2839 0.2281
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.255 0.0223 0.2991 0.2109
NON/ShiLtJ f 0.1929 0.0119 0.2164 0.1693
NON/ShiLtJ m 0.2 0.0223 0.2441 0.1559
PWD/PhJ f 0.1167 0.0129 0.1421 0.0912
PWD/PhJ m 0.1812 0.0111 0.2033 0.1592
RIIIS/J f 0.17 0.0141 0.1979 0.1421
RIIIS/J m 0.235 0.0129 0.2604 0.2096
SM/J f 0.1424 0.0141 0.1703 0.1145
SM/J m 0.15 0.0141 0.1779 0.1221
WSB/EiJ f 0.11 0.0182 0.146 0.074
WSB/EiJ m 0.0917 0.0129 0.1171 0.0662


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.1408 0.0095 0.1597 0.122
A/J both 0.18 0.0129 0.2054 0.1546
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.1336 0.0099 0.1531 0.114
C3H/HeJ both 0.1754 0.0102 0.1955 0.1553
C57BL/10J both 0.3707 0.0095 0.3895 0.3518
C57BR/cdJ both 0.2761 0.0083 0.2925 0.2597
C57L/J both 0.1675 0.0091 0.1855 0.1495
DBA/2J both 0.1542 0.0102 0.1743 0.1341
FVB/NJ both 0.1515 0.0095 0.1704 0.1326
KK/HlJ both 0.4396 0.0126 0.4646 0.4147
LP/J both 0.1735 0.0095 0.1924 0.1546
MRL/MpJ both 0.165 0.0158 0.1961 0.1339
NOD.B10Sn-H2b/J both 0.2555 0.0132 0.2816 0.2294
NON/ShiLtJ both 0.1964 0.0126 0.2214 0.1715
PWD/PhJ both 0.149 0.0085 0.1658 0.1321
RIIIS/J both 0.2025 0.0095 0.2214 0.1836
SM/J both 0.1462 0.01 0.1659 0.1265
WSB/EiJ both 0.1008 0.0111 0.1229 0.0788




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS