Project measure / variable:   Mills1   all_micronucl_M12

ID, description, units MPD:25236   all_micronucl_M12   non-nucleated peripheral blood cells with micronuclei   [%]  at age 12mo  
Data set, strains Mills1   inbred   30 strains     sex: both     age: 52wks
Procedure chromosome instability assessment
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Mills1 - non-nucleated peripheral blood cells with micronuclei at age 12mo



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested26 strains28 strains
Mean of the strain means0.190   % 0.274   %
Median of the strain means0.165   % 0.226   %
SD of the strain means± 0.0868 ± 0.133
Coefficient of variation (CV)0.457 0.486
Min–max range of strain means0.0998   –   0.478   % 0.122   –   0.683   %
Mean sample size per strain5.5   mice 5.0   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.5288 0.5288 43.3043 < 0.0001
strain 23 2.1118 0.0918 7.5193 < 0.0001
sex:strain 23 1.1695 0.0508 4.1641 < 0.0001
Residuals 208 2.5399 0.0122


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.13 0.0155   6 0.00632 0.119 0.12, 0.16 -0.69
129S1/SvImJ m 0.302 0.313   9 0.104 1.04 0.14, 1.12 0.21
A/J m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.55
AKR/J f 0.2 0.122   3 0.0702 0.608 0.12, 0.34 0.12
AKR/J m 0.348 0.365   5 0.163 1.05 0.16, 1.0 0.56
BALB/cByJ f 0.21 0.0141   4 0.00707 0.0673 0.19, 0.22 0.23
BALB/cByJ m 0.237 0.0208   3 0.012 0.088 0.22, 0.26 -0.28
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.163 0.051   7 0.0193 0.312 0.089, 0.21 -0.31
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.147 0.149   6 0.0608 1.01 0.072, 0.45 -0.95
BUB/BnJ f 0.217 0.0359   7 0.0136 0.165 0.17, 0.27 0.31
BUB/BnJ m 0.225 0.0495   2   0.035 0.22 0.19, 0.26 -0.37
C3H/HeJ m 0.22 0.02   5 0.00894 0.0909 0.19, 0.24 -0.4
C57BL/10J m 0.47 0.051   5 0.0228 0.108 0.42, 0.53 1.47
C57BL/6J f 0.153 0.0635   6 0.0259 0.414 0.11, 0.28 -0.43
C57BL/6J m 0.278 0.0354   6 0.0145 0.127 0.24, 0.33 0.03
C57BLKS/J f 0.133 0.0153   3 0.00882 0.115 0.12, 0.15 -0.66
C57BLKS/J m 0.187 0.028   6 0.0115 0.15 0.14, 0.22 -0.65
C57BR/cdJ f 0.191 0.0183   9 0.00611 0.0959 0.17, 0.22 0.01
C57BR/cdJ m 0.477 0.147   4 0.0733 0.307 0.36, 0.68 1.52
C57L/J f 0.14 0.0   5 0.0 0.0 0.14, 0.14 -0.57
C57L/J m 0.162 0.0164   5 0.00735 0.101 0.15, 0.19 -0.84
CBA/J f 0.0998 0.0141   6 0.00575 0.141 0.082, 0.12 -1.04
CBA/J m 0.127 0.0121   6 0.00494 0.0956 0.11, 0.14 -1.1
DBA/2J f 0.128 0.0172   6 0.00703 0.134 0.11, 0.15 -0.71
DBA/2J m 0.17 0.02   3 0.0115 0.118 0.15, 0.19 -0.78
FVB/NJ f 0.157 0.0207   6 0.00843 0.132 0.12, 0.18 -0.38
FVB/NJ m 0.216 0.0602   5 0.0269 0.279 0.17, 0.3 -0.43
KK/HlJ f 0.167 0.0225   6 0.00919 0.135 0.15, 0.2 -0.26
KK/HlJ m 0.683 0.055   7 0.0208 0.0805 0.61, 0.76 3.07
LP/J f 0.154 0.0207   5 0.00927 0.135 0.13, 0.18 -0.41
LP/J m 0.203 0.0115   3 0.00667 0.0568 0.19, 0.21 -0.53
MRL/MpJ f 0.352 0.369   6 0.151 1.05 0.14, 1.1 1.87
MRL/MpJ m 0.164 0.00894   5 0.004 0.0545 0.15, 0.17 -0.83
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.173 0.0126   4 0.00629 0.0729 0.16, 0.19 -0.19
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.163 0.0115   3 0.00667 0.0707 0.15, 0.17 -0.83
NON/ShiLtJ f 0.262 0.0563   9 0.0188 0.215 0.18, 0.35 0.83
NON/ShiLtJ m 0.307 0.0725   8 0.0256 0.236 0.21, 0.4 0.25
NZO/HlLtJ f 0.18 0.0141   2   0.01 0.0786 0.17, 0.19 -0.11
NZO/HlLtJ m 0.43 0.0653   4 0.0327 0.152 0.35, 0.51 1.17
NZW/LacJ f 0.178 0.00957   4 0.00479 0.0539 0.17, 0.19 -0.14
NZW/LacJ m 0.227 0.0197   6 0.00803 0.0868 0.21, 0.26 -0.35
P/J m 0.34 0.0515   5 0.023 0.151 0.29, 0.42 0.5
PL/J f 0.478 0.0683   5 0.0306 0.143 0.41, 0.59 3.32
PL/J m 0.496 0.0365   5 0.0163 0.0735 0.45, 0.54 1.67
PWD/PhJ f 0.138 0.00408   6 0.00167 0.0295 0.13, 0.14 -0.6
PWD/PhJ m 0.202 0.111   5 0.0496 0.549 0.14, 0.4 -0.54
RIIIS/J f 0.137 0.0273   6 0.0112 0.2 0.1, 0.16 -0.61
RIIIS/J m 0.245 0.012   8 0.00423 0.0488 0.23, 0.26 -0.22
SJL/J f 0.363 0.0599   6 0.0244 0.165 0.3, 0.47 2.0
SM/J f 0.107 0.022   6 0.00898 0.206 0.076, 0.14 -0.96
SM/J m 0.323 0.0306   3 0.0176 0.0945 0.29, 0.35 0.37
SWR/J f 0.194 0.0167   5 0.00748 0.0863 0.18, 0.22 0.05
WSB/EiJ f 0.132 0.093   6 0.0379 0.705 0.077, 0.32 -0.67
WSB/EiJ m 0.122 0.0699   6 0.0286 0.571 0.058, 0.21 -1.14


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.13 0.0451 0.2189 0.0411
129S1/SvImJ m 0.3022 0.0368 0.3748 0.2296
AKR/J f 0.2 0.0638 0.3258 0.0742
AKR/J m 0.348 0.0494 0.4454 0.2506
BALB/cByJ f 0.21 0.0553 0.3189 0.1011
BALB/cByJ m 0.2367 0.0638 0.3624 0.1109
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.1634 0.0418 0.2458 0.0811
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.1473 0.0451 0.2363 0.0584
BUB/BnJ f 0.2171 0.0418 0.2995 0.1348
BUB/BnJ m 0.225 0.0781 0.379 0.071
C57BL/6J f 0.1533 0.0451 0.2423 0.0644
C57BL/6J m 0.2783 0.0451 0.3673 0.1894
C57BLKS/J f 0.1333 0.0638 0.2591 0.0076
C57BLKS/J m 0.1867 0.0451 0.2756 0.0977
C57BR/cdJ f 0.1911 0.0368 0.2637 0.1185
C57BR/cdJ m 0.4775 0.0553 0.5864 0.3686
C57L/J f 0.14 0.0494 0.2374 0.0426
C57L/J m 0.162 0.0494 0.2594 0.0646
CBA/J f 0.0998 0.0451 0.1888 0.0109
CBA/J m 0.1267 0.0451 0.2156 0.0377
DBA/2J f 0.1283 0.0451 0.2173 0.0394
DBA/2J m 0.17 0.0638 0.2958 0.0442
FVB/NJ f 0.1567 0.0451 0.2456 0.0677
FVB/NJ m 0.216 0.0494 0.3134 0.1186
KK/HlJ f 0.1667 0.0451 0.2556 0.0777
KK/HlJ m 0.6829 0.0418 0.7652 0.6005
LP/J f 0.154 0.0494 0.2514 0.0566
LP/J m 0.2033 0.0638 0.3291 0.0776
MRL/MpJ f 0.3517 0.0451 0.4406 0.2627
MRL/MpJ m 0.164 0.0494 0.2614 0.0666
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.1725 0.0553 0.2814 0.0636
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.1633 0.0638 0.2891 0.0376
NON/ShiLtJ f 0.2622 0.0368 0.3348 0.1896
NON/ShiLtJ m 0.3075 0.0391 0.3845 0.2305
NZO/HlLtJ f 0.18 0.0781 0.334 0.026
NZO/HlLtJ m 0.43 0.0553 0.5389 0.3211
NZW/LacJ f 0.1775 0.0553 0.2864 0.0686
NZW/LacJ m 0.2267 0.0451 0.3156 0.1377
PL/J f 0.478 0.0494 0.5754 0.3806
PL/J m 0.496 0.0494 0.5934 0.3986
PWD/PhJ f 0.1383 0.0451 0.2273 0.0494
PWD/PhJ m 0.202 0.0494 0.2994 0.1046
RIIIS/J f 0.1367 0.0451 0.2256 0.0477
RIIIS/J m 0.245 0.0391 0.322 0.168
SM/J f 0.1068 0.0451 0.1958 0.0179
SM/J m 0.3233 0.0638 0.4491 0.1976
WSB/EiJ f 0.1318 0.0451 0.2208 0.0429
WSB/EiJ m 0.1225 0.0451 0.2114 0.0336


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.2161 0.0291 0.2735 0.1587
AKR/J both 0.274 0.0404 0.3535 0.1945
BALB/cByJ both 0.2233 0.0422 0.3065 0.1401
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.1554 0.0307 0.216 0.0948
BUB/BnJ both 0.2211 0.0443 0.3084 0.1337
C57BL/6J both 0.2158 0.0319 0.2787 0.1529
C57BLKS/J both 0.16 0.0391 0.237 0.083
C57BR/cdJ both 0.3343 0.0332 0.3998 0.2688
C57L/J both 0.151 0.0349 0.2199 0.0821
CBA/J both 0.1132 0.0319 0.1761 0.0504
DBA/2J both 0.1492 0.0391 0.2262 0.0721
FVB/NJ both 0.1863 0.0335 0.2523 0.1204
KK/HlJ both 0.4248 0.0307 0.4854 0.3642
LP/J both 0.1787 0.0404 0.2582 0.0991
MRL/MpJ both 0.2578 0.0335 0.3238 0.1919
NOD.B10Sn-H2b/J both 0.1679 0.0422 0.2511 0.0847
NON/ShiLtJ both 0.2849 0.0268 0.3378 0.2319
NZO/HlLtJ both 0.305 0.0478 0.3993 0.2107
NZW/LacJ both 0.2021 0.0357 0.2724 0.1318
PL/J both 0.487 0.0349 0.5559 0.4181
PWD/PhJ both 0.1702 0.0335 0.2361 0.1042
RIIIS/J both 0.1908 0.0298 0.2497 0.132
SM/J both 0.2151 0.0391 0.2921 0.1381
WSB/EiJ both 0.1272 0.0319 0.1901 0.0643




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS