Project measure / variable:   Mills1   RBC_micronucl_M20

ID, description, units MPD:25233   RBC_micronucl_M20   red blood cells (RBC) with micronuclei   [%]  at age 20mo  
Data set, strains Mills1   inbred   25 strains     sex: both     age: 87wks
Procedure chromosome instability assessment
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Mills1 - red blood cells (RBC) with micronuclei at age 20mo



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested23 strains22 strains
Mean of the strain means0.153   % 0.208   %
Median of the strain means0.130   % 0.177   %
SD of the strain means± 0.0768 ± 0.110
Coefficient of variation (CV)0.502 0.526
Min–max range of strain means0.0948   –   0.462   % 0.0838   –   0.505   %
Mean sample size per strain5.3   mice 4.3   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.2999 0.2999 147.5493 < 0.0001
strain 17 0.806 0.0474 23.3294 < 0.0001
sex:strain 17 0.3445 0.0203 9.9711 < 0.0001
Residuals 145 0.2947 0.002


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.107 0.00926   6 0.00378 0.0864 0.094, 0.12 -0.6
129S1/SvImJ m 0.13 0.0158   5 0.00707 0.122 0.11, 0.15 -0.72
A/J f 0.13 0.0   3 0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.3
A/J m 0.213 0.0115   3 0.00667 0.0541 0.2, 0.22 0.04
BALB/cByJ f 0.238 0.037   5 0.0166 0.156 0.19, 0.28 1.11
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.103 0.0171   7 0.00646 0.166 0.072, 0.12 -0.65
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.142 0.106   4 0.053 0.749 0.082, 0.3 -0.61
BUB/BnJ f 0.166 0.0288   5 0.0129 0.174 0.14, 0.21 0.17
BUB/BnJ m 0.18 0.0   1   0.0 0.0 0.18, 0.18 -0.26
C3H/HeJ f 0.106 0.007   4 0.0035 0.0657 0.096, 0.11 -0.61
C3H/HeJ m 0.202 0.0204   6 0.00833 0.101 0.18, 0.24 -0.06
C57BL/10J f 0.184 0.023   5 0.0103 0.125 0.15, 0.2 0.41
C57BL/10J m 0.505 0.0243   6 0.00992 0.0481 0.48, 0.55 2.71
C57BL/6J f 0.147 0.0151   6 0.00615 0.103 0.12, 0.16 -0.08
C57BLKS/J m 0.165 0.0212   2   0.015 0.129 0.15, 0.18 -0.4
C57BR/cdJ f 0.168 0.0585   6 0.0239 0.347 0.12, 0.28 0.2
C57BR/cdJ m 0.332 0.0545   9 0.0182 0.164 0.25, 0.42 1.13
C57L/J f 0.127 0.0103   6 0.00422 0.0815 0.11, 0.14 -0.34
C57L/J m 0.23 0.0663   6 0.0271 0.288 0.15, 0.32 0.2
CBA/J m 0.105 0.00548   6 0.00224 0.0522 0.1, 0.11 -0.94
DBA/2J f 0.0963 0.0115   6 0.00469 0.119 0.081, 0.11 -0.74
DBA/2J m 0.152 0.0275   4 0.0138 0.181 0.12, 0.18 -0.52
FVB/NJ f 0.119 0.0209   6 0.00854 0.176 0.084, 0.14 -0.44
FVB/NJ m 0.146 0.0114   5 0.0051 0.0781 0.13, 0.16 -0.57
KK/HlJ f 0.16 0.0183   7 0.0069 0.114 0.14, 0.19 0.09
KK/HlJ m 0.465 0.375   2   0.265 0.806 0.2, 0.73 2.34
LP/J f 0.128 0.013   5 0.00583 0.102 0.11, 0.14 -0.32
LP/J m 0.208 0.0279   6 0.0114 0.134 0.18, 0.26 0.0
MRL/MpJ f 0.155 0.00707   2   0.005 0.0456 0.15, 0.16 0.03
MRL/MpJ m 0.135 0.00707   2   0.005 0.0524 0.13, 0.14 -0.67
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.198 0.0421   5 0.0188 0.212 0.16, 0.27 0.59
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.195 0.0495   2   0.035 0.254 0.16, 0.23 -0.12
NON/ShiLtJ f 0.167 0.018   7 0.0068 0.108 0.15, 0.2 0.18
NON/ShiLtJ m 0.175 0.00707   2   0.005 0.0404 0.17, 0.18 -0.31
P/J f 0.13 0.0141   5 0.00632 0.109 0.11, 0.15 -0.3
P/J m 0.34 0.0   1   0.0 0.0 0.34, 0.34 1.2
PL/J f 0.462 0.0769   5 0.0344 0.167 0.37, 0.56 4.03
PWD/PhJ f 0.0948 0.00542   6 0.00221 0.0571 0.088, 0.1 -0.76
PWD/PhJ m 0.153 0.0296   8 0.0105 0.194 0.12, 0.2 -0.51
RIIIS/J f 0.13 0.01   5 0.00447 0.0769 0.12, 0.14 -0.3
RIIIS/J m 0.215 0.0295   6 0.012 0.137 0.19, 0.27 0.06
SM/J f 0.104 0.0382   5 0.0171 0.367 0.074, 0.17 -0.64
SM/J m 0.114 0.0186   5 0.00833 0.163 0.082, 0.13 -0.86
WSB/EiJ f 0.095 0.0137   3 0.00794 0.145 0.083, 0.11 -0.75
WSB/EiJ m 0.0838 0.0281   6 0.0115 0.336 0.061, 0.14 -1.14


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.1072 0.0184 0.1435 0.0708
129S1/SvImJ m 0.13 0.0202 0.1698 0.0902
A/J f 0.13 0.026 0.1814 0.0786
A/J m 0.2133 0.026 0.2648 0.1619
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.1033 0.017 0.137 0.0696
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.1415 0.0225 0.1861 0.0969
C3H/HeJ f 0.1065 0.0225 0.1511 0.0619
C3H/HeJ m 0.2017 0.0184 0.238 0.1653
C57BL/10J f 0.184 0.0202 0.2238 0.1442
C57BL/10J m 0.505 0.0184 0.5414 0.4686
C57BR/cdJ f 0.1683 0.0184 0.2047 0.132
C57BR/cdJ m 0.3322 0.015 0.3619 0.3025
C57L/J f 0.1267 0.0184 0.163 0.0903
C57L/J m 0.23 0.0184 0.2664 0.1936
DBA/2J f 0.0963 0.0184 0.1327 0.06
DBA/2J m 0.1525 0.0225 0.1971 0.1079
FVB/NJ f 0.119 0.0184 0.1554 0.0826
FVB/NJ m 0.146 0.0202 0.1858 0.1062
KK/HlJ f 0.16 0.017 0.1937 0.1263
KK/HlJ m 0.465 0.0319 0.528 0.402
LP/J f 0.128 0.0202 0.1678 0.0882
LP/J m 0.2083 0.0184 0.2447 0.172
MRL/MpJ f 0.155 0.0319 0.218 0.092
MRL/MpJ m 0.135 0.0319 0.198 0.072
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.198 0.0202 0.2378 0.1582
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.195 0.0319 0.258 0.132
NON/ShiLtJ f 0.1671 0.017 0.2008 0.1335
NON/ShiLtJ m 0.175 0.0319 0.238 0.112
PWD/PhJ f 0.0948 0.0184 0.1312 0.0585
PWD/PhJ m 0.1525 0.0159 0.184 0.121
RIIIS/J f 0.13 0.0202 0.1698 0.0902
RIIIS/J m 0.215 0.0184 0.2514 0.1786
SM/J f 0.104 0.0202 0.1438 0.0642
SM/J m 0.1144 0.0202 0.1542 0.0746
WSB/EiJ f 0.095 0.026 0.1464 0.0436
WSB/EiJ m 0.0838 0.0184 0.1202 0.0475


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.1186 0.0136 0.1456 0.0916
A/J both 0.1717 0.0184 0.208 0.1353
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.1224 0.0141 0.1503 0.0945
C3H/HeJ both 0.1541 0.0146 0.1828 0.1253
C57BL/10J both 0.3445 0.0136 0.3715 0.3175
C57BR/cdJ both 0.2503 0.0119 0.2738 0.2268
C57L/J both 0.1783 0.013 0.2041 0.1526
DBA/2J both 0.1244 0.0146 0.1532 0.0957
FVB/NJ both 0.1325 0.0136 0.1595 0.1055
KK/HlJ both 0.3125 0.0181 0.3482 0.2768
LP/J both 0.1682 0.0136 0.1951 0.1412
MRL/MpJ both 0.145 0.0225 0.1896 0.1004
NOD.B10Sn-H2b/J both 0.1965 0.0189 0.2338 0.1592
NON/ShiLtJ both 0.1711 0.0181 0.2068 0.1354
PWD/PhJ both 0.1237 0.0122 0.1477 0.0996
RIIIS/J both 0.1725 0.0136 0.1995 0.1455
SM/J both 0.1092 0.0143 0.1374 0.081
WSB/EiJ both 0.0894 0.0159 0.1209 0.0579




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS