Phenotype measure:   Peters4   pctBASO_M06

ID, description, units MPD:24349   pctBASO_M06   basophil differential (BASO; percentage of total WBC)   [%]  at age 6mo
Data set, strains Peters4   inbred   30 strains     sex: both     age: 26wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Peters4 - basophil differential (BASO; percentage of total WBC) at age 6mo



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested30 strains30 strains
Mean of the strain means0.292   % 0.286   %
Median of the strain means0.259   % 0.233   %
SD of the strain means± 0.119 ± 0.152
Coefficient of variation (CV)0.407 0.531
Min–max range of strain means0.150   –   0.588   % 0.100   –   0.813   %
Mean sample size per strain7.7   mice 7.4   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0047 0.0047 0.2647 0.6072
strain 29 6.4422 0.2221 12.4273 < 0.0001
sex:strain 29 1.6262 0.0561 3.1369 < 0.0001
Residuals 393 7.0251 0.0179


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.163 0.0518   8 0.0183 0.318 0.1, 0.2 -1.09
129S1/SvImJ m 0.242 0.0669   12 0.0193 0.277 0.1, 0.3 -0.29
A/J f 0.22 0.0837   5 0.0374 0.38 0.1, 0.3 -0.61
A/J m 0.225 0.139   8 0.0491 0.617 0.1, 0.5 -0.4
BALB/cByJ f 0.483 0.479   6 0.196 0.992 0.1, 1.4 1.6
BALB/cByJ m 0.438 0.177   8 0.0625 0.404 0.2, 0.7 1.01
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.287 0.0835   8 0.0295 0.29 0.2, 0.4 -0.05
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.175 0.0707   8 0.025 0.404 0.1, 0.3 -0.73
BUB/BnJ f 0.212 0.0354   8 0.0125 0.166 0.2, 0.3 -0.68
BUB/BnJ m 0.457 0.288   7 0.109 0.63 0.1, 1.0 1.13
C3H/HeJ f 0.257 0.0787   7 0.0297 0.306 0.2, 0.4 -0.3
C3H/HeJ m 0.137 0.0744   8 0.0263 0.541 0.1, 0.3 -0.98
C57BL/10J f 0.375 0.104   8 0.0366 0.276 0.2, 0.5 0.69
C57BL/10J m 0.583 0.279   6 0.114 0.478 0.3, 1.1 1.96
C57BL/6J f 0.387 0.125   8 0.0441 0.322 0.2, 0.6 0.79
C57BL/6J m 0.3 0.11   6 0.0447 0.365 0.2, 0.5 0.1
C57BLKS/J f 0.438 0.119   8 0.042 0.271 0.3, 0.6 1.22
C57BLKS/J m 0.243 0.0535   7 0.0202 0.22 0.2, 0.3 -0.28
C57BR/cdJ f 0.471 0.138   7 0.0522 0.293 0.3, 0.7 1.5
C57BR/cdJ m 0.45 0.107   8 0.0378 0.238 0.3, 0.6 1.08
C57L/J f 0.3 0.0926   8 0.0327 0.309 0.2, 0.5 0.06
C57L/J m 0.225 0.0707   8 0.025 0.314 0.2, 0.4 -0.4
CAST/EiJ f 0.23 0.0675   10 0.0213 0.293 0.1, 0.3 -0.52
CAST/EiJ m 0.3 0.141   2   0.1 0.471 0.2, 0.4 0.1
CBA/J f 0.2 0.0632   6 0.0258 0.316 0.1, 0.3 -0.78
CBA/J m 0.188 0.0835   8 0.0295 0.445 0.1, 0.3 -0.64
DBA/2J f 0.3 0.0816   7 0.0309 0.272 0.2, 0.4 0.06
DBA/2J m 0.386 0.157   7 0.0595 0.408 0.2, 0.6 0.66
FVB/NJ f 0.175 0.0463   8 0.0164 0.265 0.1, 0.2 -0.99
FVB/NJ m 0.1 0.0816   7 0.0309 0.816 -1.22
KK/HlJ f 0.367 0.0816   6 0.0333 0.223 0.3, 0.5 0.63
KK/HlJ m 0.4 0.16   8 0.0567 0.401 0.2, 0.7 0.75
LP/J f 0.55 0.105   6 0.0428 0.191 0.4, 0.7 2.16
LP/J m 0.225 0.0707   8 0.025 0.314 0.2, 0.4 -0.4
MRL/MpJ f 0.175 0.116   8 0.0412 0.666 0.1, 0.4 -0.99
MRL/MpJ m 0.26 0.152   5 0.0678 0.583 0.1, 0.5 -0.17
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.588 0.36   8 0.127 0.613 0.3, 1.4 2.48
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.813 0.27   8 0.0953 0.332 0.5, 1.3 3.48
NON/ShiLtJ f 0.15 0.0756   8 0.0267 0.504 0.1, 0.3 -1.2
NON/ShiLtJ m 0.183 0.0753   6 0.0307 0.411 0.1, 0.3 -0.68
NZO/HlLtJ f 0.212 0.0354   8 0.0125 0.166 0.2, 0.3 -0.68
NZO/HlLtJ m 0.2 0.0816   7 0.0309 0.408 0.1, 0.3 -0.56
NZW/LacJ f 0.212 0.0354   8 0.0125 0.166 0.2, 0.3 -0.68
NZW/LacJ m 0.2 0.0632   6 0.0258 0.316 0.1, 0.3 -0.56
P/J f 0.175 0.128   8 0.0453 0.732 -0.99
P/J m 0.35 0.193   8 0.0681 0.551 0.2, 0.8 0.43
PL/J f 0.385 0.128   13 0.0355 0.333 0.2, 0.7 0.78
PL/J m 0.3 0.107   8 0.0378 0.356 0.2, 0.5 0.1
PWD/PhJ f 0.188 0.0835   8 0.0295 0.445 0.1, 0.3 -0.88
PWD/PhJ m 0.157 0.0787   7 0.0297 0.501 0.1, 0.3 -0.85
RIIIS/J f 0.212 0.0835   8 0.0295 0.393 0.1, 0.3 -0.68
RIIIS/J m 0.125 0.0463   8 0.0164 0.37 0.1, 0.2 -1.06
SJL/J f 0.263 0.0916   8 0.0324 0.349 0.1, 0.4 -0.25
SJL/J m 0.2 0.0535   8 0.0189 0.267 0.1, 0.3 -0.56
SM/J f 0.25 0.0837   6 0.0342 0.335 0.2, 0.4 -0.36
SM/J m 0.15 0.0535   8 0.0189 0.356 0.1, 0.2 -0.89
SWR/J f 0.288 0.0641   8 0.0227 0.223 0.2, 0.4 -0.04
SWR/J m 0.225 0.139   8 0.0491 0.617 0.1, 0.5 -0.4
WSB/EiJ f 0.26 0.107   10 0.034 0.413 0.1, 0.4 -0.27
WSB/EiJ m 0.329 0.125   7 0.0474 0.382 0.2, 0.6 0.29


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.1625 0.0473 0.2554 0.0696
129S1/SvImJ m 0.2417 0.0386 0.3175 0.1658
A/J f 0.22 0.0598 0.3376 0.1024
A/J m 0.225 0.0473 0.3179 0.1321
BALB/cByJ f 0.4833 0.0546 0.5906 0.376
BALB/cByJ m 0.4375 0.0473 0.5304 0.3446
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.2875 0.0473 0.3804 0.1946
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.175 0.0473 0.2679 0.0821
BUB/BnJ f 0.2125 0.0473 0.3054 0.1196
BUB/BnJ m 0.4571 0.0505 0.5565 0.3578
C3H/HeJ f 0.2571 0.0505 0.3565 0.1578
C3H/HeJ m 0.1375 0.0473 0.2304 0.0446
C57BL/10J f 0.375 0.0473 0.4679 0.2821
C57BL/10J m 0.5833 0.0546 0.6906 0.476
C57BL/6J f 0.3875 0.0473 0.4804 0.2946
C57BL/6J m 0.3 0.0546 0.4073 0.1927
C57BLKS/J f 0.4375 0.0473 0.5304 0.3446
C57BLKS/J m 0.2429 0.0505 0.3422 0.1435
C57BR/cdJ f 0.4714 0.0505 0.5708 0.3721
C57BR/cdJ m 0.45 0.0473 0.5429 0.3571
C57L/J f 0.3 0.0473 0.3929 0.2071
C57L/J m 0.225 0.0473 0.3179 0.1321
CAST/EiJ f 0.23 0.0423 0.3131 0.1469
CAST/EiJ m 0.3 0.0945 0.4859 0.1141
CBA/J f 0.2 0.0546 0.3073 0.0927
CBA/J m 0.1875 0.0473 0.2804 0.0946
DBA/2J f 0.3 0.0505 0.3994 0.2006
DBA/2J m 0.3857 0.0505 0.4851 0.2864
FVB/NJ f 0.175 0.0473 0.2679 0.0821
FVB/NJ m 0.1 0.0505 0.1994 0.0006
KK/HlJ f 0.3667 0.0546 0.474 0.2594
KK/HlJ m 0.4 0.0473 0.4929 0.3071
LP/J f 0.55 0.0546 0.6573 0.4427
LP/J m 0.225 0.0473 0.3179 0.1321
MRL/MpJ f 0.175 0.0473 0.2679 0.0821
MRL/MpJ m 0.26 0.0598 0.3776 0.1424
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.5875 0.0473 0.6804 0.4946
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.8125 0.0473 0.9054 0.7196
NON/ShiLtJ f 0.15 0.0473 0.2429 0.0571
NON/ShiLtJ m 0.1833 0.0546 0.2906 0.076
NZO/HlLtJ f 0.2125 0.0473 0.3054 0.1196
NZO/HlLtJ m 0.2 0.0505 0.2994 0.1006
NZW/LacJ f 0.2125 0.0473 0.3054 0.1196
NZW/LacJ m 0.2 0.0546 0.3073 0.0927
P/J f 0.175 0.0473 0.2679 0.0821
P/J m 0.35 0.0473 0.4429 0.2571
PL/J f 0.3846 0.0371 0.4575 0.3117
PL/J m 0.3 0.0473 0.3929 0.2071
PWD/PhJ f 0.1875 0.0473 0.2804 0.0946
PWD/PhJ m 0.1571 0.0505 0.2565 0.0578
RIIIS/J f 0.2125 0.0473 0.3054 0.1196
RIIIS/J m 0.125 0.0473 0.2179 0.0321
SJL/J f 0.2625 0.0473 0.3554 0.1696
SJL/J m 0.2 0.0473 0.2929 0.1071
SM/J f 0.25 0.0546 0.3573 0.1427
SM/J m 0.15 0.0473 0.2429 0.0571
SWR/J f 0.2875 0.0473 0.3804 0.1946
SWR/J m 0.225 0.0473 0.3179 0.1321
WSB/EiJ f 0.26 0.0423 0.3431 0.1769
WSB/EiJ m 0.3286 0.0505 0.4279 0.2292


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.2021 0.0305 0.2621 0.1421
A/J both 0.2225 0.0381 0.2974 0.1476
BALB/cByJ both 0.4604 0.0361 0.5314 0.3894
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.2312 0.0334 0.297 0.1655
BUB/BnJ both 0.3348 0.0346 0.4028 0.2668
C3H/HeJ both 0.1973 0.0346 0.2653 0.1293
C57BL/10J both 0.4792 0.0361 0.5501 0.4082
C57BL/6J both 0.3437 0.0361 0.4147 0.2728
C57BLKS/J both 0.3402 0.0346 0.4082 0.2722
C57BR/cdJ both 0.4607 0.0346 0.5287 0.3927
C57L/J both 0.2625 0.0334 0.3282 0.1968
CAST/EiJ both 0.265 0.0518 0.3668 0.1632
CBA/J both 0.1937 0.0361 0.2647 0.1228
DBA/2J both 0.3429 0.0357 0.4131 0.2726
FVB/NJ both 0.1375 0.0346 0.2055 0.0695
KK/HlJ both 0.3833 0.0361 0.4543 0.3124
LP/J both 0.3875 0.0361 0.4585 0.3165
MRL/MpJ both 0.2175 0.0381 0.2924 0.1426
NOD.B10Sn-H2b/J both 0.7 0.0334 0.7657 0.6343
NON/ShiLtJ both 0.1667 0.0361 0.2376 0.0957
NZO/HlLtJ both 0.2062 0.0346 0.2743 0.1382
NZW/LacJ both 0.2062 0.0361 0.2772 0.1353
P/J both 0.2625 0.0334 0.3282 0.1968
PL/J both 0.3423 0.03 0.4014 0.2832
PWD/PhJ both 0.1723 0.0346 0.2403 0.1043
RIIIS/J both 0.1687 0.0334 0.2345 0.103
SJL/J both 0.2312 0.0334 0.297 0.1655
SM/J both 0.2 0.0361 0.271 0.129
SWR/J both 0.2562 0.0334 0.322 0.1905
WSB/EiJ both 0.2943 0.0329 0.3591 0.2295




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS