Project measure / variable:   Peters4   LUC_M06

ID, description, units MPD:24329   LUC_M06   large unstained cells count (LUC; units per volume x 103)   [n/µL]  at age 6mo  
Data set, strains Peters4   inbred   30 strains     sex: both     age: 26wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Peters4 - large unstained cells count (LUC; units per volume x 103) at age 6mo



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested30 strains30 strains
Mean of the strain means0.0684   n/µL 0.0876   n/µL
Median of the strain means0.0504   n/µL 0.0682   n/µL
SD of the strain means± 0.0424 ± 0.0588
Coefficient of variation (CV)0.620 0.672
Min–max range of strain means0.0250   –   0.176   n/µL 0.0250   –   0.224   n/µL
Mean sample size per strain7.7   mice 7.3   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0418 0.0418 16.5984 0.0001
strain 29 0.9192 0.0317 12.5904 < 0.0001
sex:strain 29 0.1976 0.0068 2.7064 < 0.0001
Residuals 392 0.9868 0.0025


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.04 0.00756   8 0.00267 0.189 0.03, 0.05 -0.67
129S1/SvImJ m 0.04 0.0141   12 0.00408 0.354 0.02, 0.07 -0.81
A/J f 0.068 0.0626   5 0.028 0.921 0.01, 0.15 -0.01
A/J m 0.0275 0.00886   8 0.00313 0.322 0.01, 0.04 -1.02
BALB/cByJ f 0.0433 0.0103   6 0.00422 0.238 0.03, 0.06 -0.59
BALB/cByJ m 0.0713 0.021   8 0.00743 0.295 0.05, 0.11 -0.28
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.095 0.0307   8 0.0109 0.323 0.05, 0.13 0.63
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0663 0.0213   8 0.00754 0.322 0.04, 0.1 -0.36
BUB/BnJ f 0.0725 0.0385   8 0.0136 0.53 0.04, 0.15 0.1
BUB/BnJ m 0.104 0.0574   7 0.0217 0.55 0.05, 0.21 0.28
C3H/HeJ f 0.0629 0.0355   7 0.0134 0.564 0.04, 0.14 -0.13
C3H/HeJ m 0.035 0.0177   8 0.00627 0.507 0.01, 0.07 -0.89
C57BL/10J f 0.124 0.0329   8 0.0116 0.266 0.08, 0.18 1.31
C57BL/10J m 0.197 0.0266   6 0.0109 0.135 0.17, 0.23 1.86
C57BL/6J f 0.0387 0.0146   8 0.00515 0.376 0.02, 0.06 -0.7
C57BL/6J m 0.152 0.0421   5 0.0188 0.277 0.09, 0.2 1.1
C57BLKS/J f 0.05 0.0256   8 0.00906 0.513 0.03, 0.09 -0.43
C57BLKS/J m 0.134 0.0431   7 0.0163 0.321 0.08, 0.22 0.79
C57BR/cdJ f 0.166 0.0364   7 0.0138 0.22 0.13, 0.24 2.31
C57BR/cdJ m 0.166 0.0245   8 0.00865 0.147 0.13, 0.2 1.33
C57L/J f 0.105 0.0374   8 0.0132 0.356 0.05, 0.16 0.86
C57L/J m 0.104 0.0403   8 0.0143 0.389 0.05, 0.18 0.28
CAST/EiJ f 0.054 0.019   10 0.006 0.351 0.02, 0.08 -0.34
CAST/EiJ m 0.035 0.0354   2   0.025 1.01 0.01, 0.06 -0.89
CBA/J f 0.0333 0.0151   6 0.00615 0.452 0.02, 0.06 -0.83
CBA/J m 0.0813 0.0718   8 0.0254 0.884 0.03, 0.25 -0.11
DBA/2J f 0.0657 0.0162   7 0.00612 0.246 0.05, 0.1 -0.06
DBA/2J m 0.06 0.0316   7 0.012 0.527 0.02, 0.12 -0.47
FVB/NJ f 0.0387 0.00991   8 0.0035 0.256 0.02, 0.05 -0.7
FVB/NJ m 0.0357 0.023   7 0.00869 0.644 0.01, 0.07 -0.88
KK/HlJ f 0.0467 0.0197   6 0.00803 0.421 0.03, 0.08 -0.51
KK/HlJ m 0.105 0.107   8 0.0379 1.02 0.02, 0.35 0.3
LP/J f 0.155 0.0572   6 0.0233 0.369 0.09, 0.23 2.05
LP/J m 0.216 0.236   8 0.0833 1.09 0.08, 0.79 2.18
MRL/MpJ f 0.0262 0.013   8 0.0046 0.496 0.01, 0.04 -1.0
MRL/MpJ m 0.064 0.0344   5 0.0154 0.537 0.03, 0.11 -0.4
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.0375 0.0139   8 0.00491 0.37 0.02, 0.06 -0.73
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.0425 0.0167   8 0.0059 0.393 0.01, 0.06 -0.77
NON/ShiLtJ f 0.0388 0.0181   8 0.00639 0.467 0.02, 0.07 -0.7
NON/ShiLtJ m 0.0433 0.0207   6 0.00843 0.477 0.01, 0.06 -0.75
NZO/HlLtJ f 0.109 0.0522   8 0.0185 0.48 0.05, 0.21 0.96
NZO/HlLtJ m 0.0943 0.023   7 0.00869 0.244 0.06, 0.13 0.11
NZW/LacJ f 0.176 0.0385   8 0.0136 0.219 0.13, 0.23 2.54
NZW/LacJ m 0.175 0.0715   6 0.0292 0.408 0.06, 0.27 1.49
P/J f 0.025 0.012   8 0.00423 0.478 0.01, 0.04 -1.02
P/J m 0.0813 0.0452   8 0.016 0.556 0.04, 0.18 -0.11
PL/J f 0.0508 0.0278   13 0.00772 0.548 0.02, 0.11 -0.41
PL/J m 0.025 0.00535   8 0.00189 0.214 0.02, 0.03 -1.06
PWD/PhJ f 0.0375 0.0191   8 0.00675 0.509 0.02, 0.08 -0.73
PWD/PhJ m 0.0314 0.0186   7 0.00705 0.593 0.01, 0.07 -0.95
RIIIS/J f 0.03 0.0131   8 0.00463 0.436 0.02, 0.06 -0.91
RIIIS/J m 0.04 0.012   8 0.00423 0.299 0.02, 0.06 -0.81
SJL/J f 0.0875 0.0392   8 0.0139 0.448 0.02, 0.15 0.45
SJL/J m 0.224 0.134   8 0.0474 0.599 0.03, 0.45 2.32
SM/J f 0.0417 0.0172   6 0.00703 0.413 0.02, 0.07 -0.63
SM/J m 0.0487 0.0155   8 0.00549 0.318 0.02, 0.07 -0.66
SWR/J f 0.0962 0.0737   8 0.026 0.765 0.04, 0.24 0.66
SWR/J m 0.07 0.0374   8 0.0132 0.535 0.03, 0.15 -0.3
WSB/EiJ f 0.036 0.0232   10 0.00733 0.644 0.01, 0.08 -0.76
WSB/EiJ m 0.0571 0.0399   7 0.0151 0.698 0.01, 0.11 -0.52


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.04 0.0177 0.0749 0.0051
129S1/SvImJ m 0.04 0.0145 0.0685 0.0115
A/J f 0.068 0.0224 0.1121 0.0239
A/J m 0.0275 0.0177 0.0624 0.0
BALB/cByJ f 0.0433 0.0205 0.0836 0.0031
BALB/cByJ m 0.0712 0.0177 0.1061 0.0364
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.095 0.0177 0.1299 0.0601
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0662 0.0177 0.1011 0.0314
BUB/BnJ f 0.0725 0.0177 0.1074 0.0376
BUB/BnJ m 0.1043 0.019 0.1416 0.067
C3H/HeJ f 0.0629 0.019 0.1001 0.0256
C3H/HeJ m 0.035 0.0177 0.0699 0.0001
C57BL/10J f 0.1237 0.0177 0.1586 0.0889
C57BL/10J m 0.1967 0.0205 0.2369 0.1564
C57BL/6J f 0.0387 0.0177 0.0736 0.0039
C57BL/6J m 0.152 0.0224 0.1961 0.1079
C57BLKS/J f 0.05 0.0177 0.0849 0.0151
C57BLKS/J m 0.1343 0.019 0.1716 0.097
C57BR/cdJ f 0.1657 0.019 0.203 0.1284
C57BR/cdJ m 0.1662 0.0177 0.2011 0.1314
C57L/J f 0.105 0.0177 0.1399 0.0701
C57L/J m 0.1037 0.0177 0.1386 0.0689
CAST/EiJ f 0.054 0.0159 0.0852 0.0228
CAST/EiJ m 0.035 0.0355 0.1048 0.0
CBA/J f 0.0333 0.0205 0.0736 0.0
CBA/J m 0.0813 0.0177 0.1161 0.0464
DBA/2J f 0.0657 0.019 0.103 0.0284
DBA/2J m 0.06 0.019 0.0973 0.0227
FVB/NJ f 0.0387 0.0177 0.0736 0.0039
FVB/NJ m 0.0357 0.019 0.073 0.0
KK/HlJ f 0.0467 0.0205 0.0869 0.0064
KK/HlJ m 0.105 0.0177 0.1399 0.0701
LP/J f 0.155 0.0205 0.1953 0.1147
LP/J m 0.2163 0.0177 0.2511 0.1814
MRL/MpJ f 0.0262 0.0177 0.0611 0.0
MRL/MpJ m 0.064 0.0224 0.1081 0.0199
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.0375 0.0177 0.0724 0.0026
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.0425 0.0177 0.0774 0.0076
NON/ShiLtJ f 0.0387 0.0177 0.0736 0.0039
NON/ShiLtJ m 0.0433 0.0205 0.0836 0.0031
NZO/HlLtJ f 0.1087 0.0177 0.1436 0.0739
NZO/HlLtJ m 0.0943 0.019 0.1316 0.057
NZW/LacJ f 0.1762 0.0177 0.2111 0.1414
NZW/LacJ m 0.175 0.0205 0.2153 0.1347
P/J f 0.025 0.0177 0.0599 0.0
P/J m 0.0812 0.0177 0.1161 0.0464
PL/J f 0.0508 0.0139 0.0781 0.0234
PL/J m 0.025 0.0177 0.0599 0.0
PWD/PhJ f 0.0375 0.0177 0.0724 0.0026
PWD/PhJ m 0.0314 0.019 0.0687 0.0
RIIIS/J f 0.03 0.0177 0.0649 0.0
RIIIS/J m 0.04 0.0177 0.0749 0.0051
SJL/J f 0.0875 0.0177 0.1224 0.0526
SJL/J m 0.2237 0.0177 0.2586 0.1889
SM/J f 0.0417 0.0205 0.0819 0.0014
SM/J m 0.0487 0.0177 0.0836 0.0139
SWR/J f 0.0962 0.0177 0.1311 0.0614
SWR/J m 0.07 0.0177 0.1049 0.0351
WSB/EiJ f 0.036 0.0159 0.0672 0.0048
WSB/EiJ m 0.0571 0.019 0.0944 0.0199


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.04 0.0115 0.0625 0.0175
A/J both 0.0477 0.0143 0.0759 0.0196
BALB/cByJ both 0.0573 0.0135 0.0839 0.0307
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.0806 0.0125 0.1053 0.056
BUB/BnJ both 0.0884 0.013 0.1139 0.0629
C3H/HeJ both 0.0489 0.013 0.0745 0.0234
C57BL/10J both 0.1602 0.0135 0.1868 0.1336
C57BL/6J both 0.0954 0.0143 0.1235 0.0673
C57BLKS/J both 0.0921 0.013 0.1177 0.0666
C57BR/cdJ both 0.166 0.013 0.1915 0.1405
C57L/J both 0.1044 0.0125 0.129 0.0797
CAST/EiJ both 0.0445 0.0194 0.0827 0.0063
CBA/J both 0.0573 0.0135 0.0839 0.0307
DBA/2J both 0.0629 0.0134 0.0892 0.0365
FVB/NJ both 0.0372 0.013 0.0628 0.0117
KK/HlJ both 0.0758 0.0135 0.1025 0.0492
LP/J both 0.1856 0.0135 0.2123 0.159
MRL/MpJ both 0.0451 0.0143 0.0732 0.017
NOD.B10Sn-H2b/J both 0.04 0.0125 0.0647 0.0153
NON/ShiLtJ both 0.041 0.0135 0.0677 0.0144
NZO/HlLtJ both 0.1015 0.013 0.127 0.076
NZW/LacJ both 0.1756 0.0135 0.2023 0.149
P/J both 0.0531 0.0125 0.0778 0.0285
PL/J both 0.0379 0.0113 0.06 0.0157
PWD/PhJ both 0.0345 0.013 0.06 0.0089
RIIIS/J both 0.035 0.0125 0.0597 0.0103
SJL/J both 0.1556 0.0125 0.1803 0.131
SM/J both 0.0452 0.0135 0.0718 0.0186
SWR/J both 0.0831 0.0125 0.1078 0.0585
WSB/EiJ both 0.0466 0.0124 0.0709 0.0223




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS