Phenotype measure:   Peters4   EOS_M18

ID, description, units MPD:24323   EOS_M18   eosinophil count (EOS; units per volume x 103)   [n/µL]  at age 18mo
Data set, strains Peters4   inbred   30 strains     sex: both     age: 78wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Peters4 - eosinophil count (EOS; units per volume x 103) at age 18mo



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested28 strains29 strains
Mean of the strain means0.241   n/µL 0.271   n/µL
Median of the strain means0.239   n/µL 0.261   n/µL
SD of the strain means± 0.128 ± 0.120
Coefficient of variation (CV)0.531 0.445
Min–max range of strain means0.0829   –   0.550   n/µL 0.0483   –   0.569   n/µL
Mean sample size per strain7.0   mice 7.7   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0214 0.0214 0.7782 0.3783
strain 26 3.5355 0.136 4.9353 < 0.0001
sex:strain 26 1.782 0.0685 2.4876 0.0001
Residuals 335 9.2303 0.0276


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.402 0.137   8 0.0483 0.34 0.27, 0.61 1.25
129S1/SvImJ m 0.176 0.228   7 0.0863 1.3 0.06, 0.69 -0.79
A/J f 0.261 0.121   7 0.0457 0.463 0.12, 0.46 0.15
A/J m 0.171 0.0889   15 0.0229 0.519 0.08, 0.38 -0.83
BALB/cByJ f 0.361 0.265   8 0.0936 0.733 0.13, 0.99 0.93
BALB/cByJ m 0.35 0.113   7 0.0428 0.324 0.25, 0.59 0.66
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.124 0.0534   8 0.0189 0.432 0.05, 0.19 -0.91
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.192 0.0845   6 0.0345 0.441 0.08, 0.34 -0.65
BUB/BnJ f 0.304 0.18   5 0.0807 0.593 0.08, 0.56 0.49
BUB/BnJ m 0.412 0.231   6 0.0942 0.56 0.08, 0.73 1.17
C3H/HeJ f 0.199 0.135   7 0.051 0.68 0.07, 0.45 -0.33
C3H/HeJ m 0.19 0.104   8 0.0367 0.547 0.03, 0.39 -0.67
C57BL/10J f 0.25 0.184   7 0.0696 0.736 0.07
C57BL/10J m 0.385 0.169   13 0.047 0.441 0.07, 0.66 0.95
C57BL/6J f 0.2 0.131   7 0.0495 0.655 0.1, 0.48 -0.32
C57BL/6J m 0.357 0.17   7 0.0642 0.476 0.72
C57BLKS/J m 0.569 0.195   16 0.0488 0.343 0.3, 0.89 2.48
C57BR/cdJ f 0.229 0.118   8 0.0417 0.516 0.07, 0.42 -0.1
C57BR/cdJ m 0.329 0.0897   8 0.0317 0.273 0.15, 0.42 0.48
C57L/J f 0.136 0.0443   7 0.0167 0.326 0.08, 0.21 -0.82
C57L/J m 0.329 0.164   7 0.0622 0.501 0.17, 0.68 0.48
CAST/EiJ f 0.285 0.193   8 0.0683 0.678 0.14, 0.73 0.34
CBA/J f 0.115 0.00707   2   0.005 0.0615 0.11, 0.12 -0.98
CBA/J m 0.084 0.055   5 0.0246 0.655 0.03, 0.16 -1.55
DBA/2J f 0.128 0.0264   6 0.0108 0.206 0.1, 0.17 -0.88
DBA/2J m 0.345 0.131   6 0.0535 0.38 0.23, 0.57 0.62
FVB/NJ f 0.0829 0.0269   7 0.0102 0.325 0.06, 0.14 -1.23
FVB/NJ m 0.138 0.0848   12 0.0245 0.616 0.03, 0.37 -1.1
KK/HlJ f 0.25 0.121   6 0.0493 0.483 0.12, 0.46 0.07
KK/HlJ m 0.386 0.103   7 0.0389 0.267 0.21, 0.5 0.96
LP/J m 0.385 0.119   8 0.042 0.309 0.13, 0.49 0.95
MRL/MpJ f 0.124 0.042   7 0.0159 0.338 0.08, 0.19 -0.91
MRL/MpJ m 0.23 0.0639   8 0.0226 0.278 0.12, 0.32 -0.34
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.153 0.0883   7 0.0334 0.577 0.08, 0.34 -0.69
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.139 0.0579   7 0.0219 0.418 0.08, 0.26 -1.1
NON/ShiLtJ f 0.444 0.333   5 0.149 0.749 0.2, 0.97 1.58
NON/ShiLtJ m 0.261 0.122   7 0.0462 0.467 0.13, 0.43 -0.08
NZO/HlLtJ f 0.117 0.0343   10 0.0109 0.293 0.08, 0.19 -0.97
NZO/HlLtJ m 0.315 0.233   2   0.165 0.741 0.15, 0.48 0.37
NZW/LacJ f 0.264 0.201   7 0.0761 0.762 0.03, 0.56 0.18
NZW/LacJ m 0.0483 0.0431   6 0.0176 0.891 0.01, 0.13 -1.85
P/J f 0.153 0.0596   7 0.0225 0.39 0.09, 0.23 -0.69
P/J m 0.17 0.192   5 0.086 1.13 0.06, 0.51 -0.84
PL/J f 0.288 0.202   8 0.0713 0.701 0.1, 0.63 0.37
PL/J m 0.229 0.117   9 0.0391 0.513 0.07, 0.41 -0.35
PWD/PhJ f 0.355 0.393   6 0.16 1.11 0.16, 1.15 0.89
PWD/PhJ m 0.283 0.196   7 0.0741 0.693 0.11, 0.61 0.1
RIIIS/J f 0.0925 0.0676   8 0.0239 0.73 0.03, 0.23 -1.16
RIIIS/J m 0.169 0.0653   8 0.0231 0.387 0.09, 0.28 -0.85
SJL/J f 0.507 0.302   7 0.114 0.596 0.18, 1.1 2.07
SJL/J m 0.205 0.0742   4 0.0371 0.362 0.12, 0.3 -0.55
SM/J f 0.09 0.021   6 0.00856 0.233 0.07, 0.12 -1.18
SM/J m 0.193 0.0904   9 0.0301 0.468 0.08, 0.33 -0.65
SWR/J f 0.289 0.225   7 0.0852 0.781 0.13, 0.77 0.37
SWR/J m 0.466 0.378   8 0.134 0.811 0.13, 1.05 1.62
WSB/EiJ f 0.55 0.431   8 0.153 0.784 0.27, 1.6 2.41
WSB/EiJ m 0.349 0.104   9 0.0347 0.298 0.17, 0.5 0.65


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.4025 0.0587 0.5179 0.2871
129S1/SvImJ m 0.1757 0.0627 0.2991 0.0523
A/J f 0.2614 0.0627 0.3848 0.138
A/J m 0.1713 0.0429 0.2556 0.087
BALB/cByJ f 0.3612 0.0587 0.4767 0.2458
BALB/cByJ m 0.35 0.0627 0.4734 0.2266
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.1237 0.0587 0.2392 0.0083
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.1917 0.0678 0.325 0.0584
BUB/BnJ f 0.304 0.0742 0.45 0.158
BUB/BnJ m 0.4117 0.0678 0.545 0.2784
C3H/HeJ f 0.1986 0.0627 0.322 0.0752
C3H/HeJ m 0.19 0.0587 0.3054 0.0746
C57BL/10J f 0.25 0.0627 0.3734 0.1266
C57BL/10J m 0.3846 0.046 0.4752 0.2941
C57BL/6J f 0.2 0.0627 0.3234 0.0766
C57BL/6J m 0.3571 0.0627 0.4806 0.2337
C57BR/cdJ f 0.2288 0.0587 0.3442 0.1133
C57BR/cdJ m 0.3288 0.0587 0.4442 0.2133
C57L/J f 0.1357 0.0627 0.2591 0.0123
C57L/J m 0.3286 0.0627 0.452 0.2052
CBA/J f 0.115 0.1174 0.3459 0.0
CBA/J m 0.084 0.0742 0.23 0.0
DBA/2J f 0.1283 0.0678 0.2616 0.0
DBA/2J m 0.345 0.0678 0.4783 0.2117
FVB/NJ f 0.0829 0.0627 0.2063 0.0
FVB/NJ m 0.1375 0.0479 0.2318 0.0432
KK/HlJ f 0.25 0.0678 0.3833 0.1167
KK/HlJ m 0.3857 0.0627 0.5091 0.2623
MRL/MpJ f 0.1243 0.0627 0.2477 0.0009
MRL/MpJ m 0.23 0.0587 0.3454 0.1146
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.1529 0.0627 0.2763 0.0294
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.1386 0.0627 0.262 0.0152
NON/ShiLtJ f 0.444 0.0742 0.59 0.298
NON/ShiLtJ m 0.2614 0.0627 0.3848 0.138
NZO/HlLtJ f 0.117 0.0525 0.2203 0.0137
NZO/HlLtJ m 0.315 0.1174 0.5459 0.0841
NZW/LacJ f 0.2643 0.0627 0.3877 0.1409
NZW/LacJ m 0.0483 0.0678 0.1816 0.0
P/J f 0.1529 0.0627 0.2763 0.0294
P/J m 0.17 0.0742 0.316 0.024
PL/J f 0.2875 0.0587 0.4029 0.1721
PL/J m 0.2289 0.0553 0.3377 0.12
PWD/PhJ f 0.355 0.0678 0.4883 0.2217
PWD/PhJ m 0.2829 0.0627 0.4063 0.1594
RIIIS/J f 0.0925 0.0587 0.2079 0.0
RIIIS/J m 0.1688 0.0587 0.2842 0.0533
SJL/J f 0.5071 0.0627 0.6306 0.3837
SJL/J m 0.205 0.083 0.3683 0.0417
SM/J f 0.09 0.0678 0.2233 0.0
SM/J m 0.1933 0.0553 0.3022 0.0845
SWR/J f 0.2886 0.0627 0.412 0.1652
SWR/J m 0.4663 0.0587 0.5817 0.3508
WSB/EiJ f 0.55 0.0587 0.6654 0.4346
WSB/EiJ m 0.3489 0.0553 0.4577 0.24


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.2891 0.043 0.3736 0.2046
A/J both 0.2164 0.038 0.2911 0.1417
BALB/cByJ both 0.3556 0.043 0.4401 0.2711
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.1577 0.0448 0.2459 0.0695
BUB/BnJ both 0.3578 0.0503 0.4567 0.259
C3H/HeJ both 0.1943 0.043 0.2788 0.1098
C57BL/10J both 0.3173 0.0389 0.3938 0.2408
C57BL/6J both 0.2786 0.0444 0.3658 0.1913
C57BR/cdJ both 0.2788 0.0415 0.3604 0.1971
C57L/J both 0.2321 0.0444 0.3194 0.1449
CBA/J both 0.0995 0.0694 0.2361 0.0
DBA/2J both 0.2367 0.0479 0.3309 0.1424
FVB/NJ both 0.1102 0.0395 0.1878 0.0325
KK/HlJ both 0.3179 0.0462 0.4087 0.227
MRL/MpJ both 0.1771 0.043 0.2616 0.0926
NOD.B10Sn-H2b/J both 0.1457 0.0444 0.233 0.0584
NON/ShiLtJ both 0.3527 0.0486 0.4483 0.2571
NZO/HlLtJ both 0.216 0.0643 0.3425 0.0895
NZW/LacJ both 0.1563 0.0462 0.2471 0.0655
P/J both 0.1614 0.0486 0.257 0.0658
PL/J both 0.2582 0.0403 0.3375 0.1789
PWD/PhJ both 0.3189 0.0462 0.4098 0.2281
RIIIS/J both 0.1306 0.0415 0.2123 0.049
SJL/J both 0.3561 0.052 0.4584 0.2537
SM/J both 0.1417 0.0437 0.2277 0.0556
SWR/J both 0.3774 0.043 0.4619 0.2929
WSB/EiJ both 0.4494 0.0403 0.5288 0.3701




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS