Project measure / variable:   Peters4   EOS_M12

ID, description, units MPD:24322   EOS_M12   eosinophil count (EOS; units per volume x 103)   [n/µL]  at age 12mo  
Data set, strains Peters4   inbred   30 strains     sex: both     age: 52wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Peters4 - eosinophil count (EOS; units per volume x 103) at age 12mo



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested30 strains30 strains
Mean of the strain means0.188   n/µL 0.229   n/µL
Median of the strain means0.168   n/µL 0.205   n/µL
SD of the strain means± 0.111 ± 0.101
Coefficient of variation (CV)0.589 0.441
Min–max range of strain means0.0625   –   0.621   n/µL 0.0375   –   0.433   n/µL
Mean sample size per strain7.8   mice 7.4   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.1945 0.1945 15.7762 0.0001
strain 29 3.6884 0.1272 10.3159 < 0.0001
sex:strain 29 1.045 0.036 2.9228 < 0.0001
Residuals 393 4.8454 0.0123


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.316 0.146   8 0.0516 0.462 0.1, 0.54 1.16
129S1/SvImJ m 0.339 0.339   7 0.128 1.0 0.12, 1.03 1.09
A/J f 0.104 0.045   7 0.017 0.432 0.06, 0.2 -0.76
A/J m 0.157 0.032   6 0.0131 0.205 0.1, 0.19 -0.71
BALB/cByJ f 0.261 0.0923   7 0.0349 0.353 0.12, 0.41 0.66
BALB/cByJ m 0.296 0.111   7 0.0421 0.376 0.15, 0.49 0.66
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.123 0.0492   8 0.0174 0.402 0.04, 0.17 -0.58
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.134 0.0417   8 0.0148 0.312 0.09, 0.21 -0.94
BUB/BnJ f 0.167 0.0243   7 0.00918 0.145 0.14, 0.2 -0.19
BUB/BnJ m 0.18 0.0764   6 0.0312 0.425 0.1, 0.29 -0.49
C3H/HeJ f 0.173 0.0468   8 0.0166 0.271 0.1, 0.25 -0.13
C3H/HeJ m 0.264 0.205   8 0.0724 0.776 0.12, 0.75 0.35
C57BL/10J f 0.219 0.0586   9 0.0195 0.268 0.13, 0.31 0.28
C57BL/10J m 0.424 0.143   8 0.0506 0.338 0.23, 0.6 1.93
C57BL/6J f 0.21 0.135   7 0.0511 0.644 0.1, 0.48 0.2
C57BL/6J m 0.307 0.092   6 0.0376 0.3 0.18, 0.45 0.77
C57BLKS/J f 0.33 0.0885   8 0.0313 0.268 0.18, 0.41 1.29
C57BLKS/J m 0.362 0.137   8 0.0483 0.377 0.16, 0.52 1.32
C57BR/cdJ f 0.176 0.0288   8 0.0102 0.163 0.13, 0.22 -0.1
C57BR/cdJ m 0.239 0.0491   8 0.0174 0.206 0.18, 0.3 0.1
C57L/J f 0.113 0.0333   8 0.0118 0.296 0.07, 0.15 -0.67
C57L/J m 0.311 0.275   8 0.0973 0.884 0.17, 0.99 0.81
CAST/EiJ f 0.245 0.217   8 0.0769 0.888 0.09, 0.77 0.52
CAST/EiJ m 0.183 0.0361   6 0.0148 0.197 0.14, 0.24 -0.46
CBA/J f 0.0837 0.013   8 0.0046 0.156 0.07, 0.1 -0.94
CBA/J m 0.11 0.0751   7 0.0284 0.682 0.06, 0.26 -1.18
DBA/2J f 0.142 0.0658   8 0.0233 0.462 0.08, 0.25 -0.41
DBA/2J m 0.124 0.0535   7 0.0202 0.43 0.08, 0.24 -1.04
FVB/NJ f 0.095 0.0251   8 0.00886 0.264 0.06, 0.14 -0.84
FVB/NJ m 0.138 0.045   8 0.0159 0.327 0.08, 0.2 -0.9
KK/HlJ f 0.189 0.0696   7 0.0263 0.369 0.11, 0.3 0.01
KK/HlJ m 0.358 0.108   11 0.0326 0.302 0.19, 0.53 1.28
LP/J f 0.345 0.113   8 0.0398 0.326 0.17, 0.5 1.42
LP/J m 0.327 0.11   7 0.0416 0.337 0.16, 0.5 0.97
MRL/MpJ f 0.154 0.0427   8 0.0151 0.278 0.09, 0.21 -0.3
MRL/MpJ m 0.181 0.0348   8 0.0123 0.192 0.13, 0.22 -0.48
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.156 0.0763   8 0.027 0.489 0.09, 0.33 -0.29
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.161 0.0582   8 0.0206 0.361 0.11, 0.29 -0.67
NON/ShiLtJ f 0.159 0.0341   9 0.0114 0.214 0.12, 0.22 -0.26
NON/ShiLtJ m 0.211 0.0875   7 0.0331 0.414 0.12, 0.37 -0.18
NZO/HlLtJ f 0.167 0.0638   6 0.026 0.383 0.09, 0.27 -0.19
NZO/HlLtJ m 0.198 0.115   5 0.0514 0.581 0.04, 0.32 -0.31
NZW/LacJ f 0.0775 0.0315   8 0.0111 0.407 0.04, 0.14 -1.0
NZW/LacJ m 0.0375 0.0149   8 0.00526 0.397 0.02, 0.06 -1.9
P/J f 0.0871 0.0198   7 0.00747 0.227 0.06, 0.11 -0.91
P/J m 0.433 0.327   3 0.189 0.755 0.22, 0.81 2.02
PL/J f 0.2 0.0606   7 0.0229 0.303 0.13, 0.29 0.11
PL/J m 0.249 0.131   9 0.0435 0.525 0.08, 0.51 0.2
PWD/PhJ f 0.168 0.0552   8 0.0195 0.33 0.09, 0.25 -0.18
PWD/PhJ m 0.154 0.0366   8 0.0129 0.238 0.09, 0.21 -0.74
RIIIS/J f 0.0625 0.0167   8 0.0059 0.267 0.04, 0.09 -1.13
RIIIS/J m 0.0929 0.039   7 0.0148 0.42 0.04, 0.14 -1.35
SJL/J f 0.621 0.328   7 0.124 0.529 0.18, 1.14 3.92
SJL/J m 0.329 0.198   8 0.0701 0.603 0.18, 0.78 0.99
SM/J f 0.0775 0.0255   8 0.00901 0.329 0.05, 0.12 -1.0
SM/J m 0.148 0.0483   8 0.0171 0.328 0.1, 0.24 -0.8
SWR/J f 0.176 0.0559   7 0.0211 0.318 0.08, 0.23 -0.1
SWR/J m 0.176 0.0515   8 0.0182 0.292 0.08, 0.25 -0.53
WSB/EiJ f 0.23 0.0566   9 0.0189 0.246 0.14, 0.35 0.38
WSB/EiJ m 0.249 0.0677   8 0.0239 0.272 0.15, 0.38 0.2


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.3162 0.0393 0.3934 0.2391
129S1/SvImJ m 0.3386 0.042 0.4211 0.2561
A/J f 0.1043 0.042 0.1868 0.0218
A/J m 0.1567 0.0453 0.2458 0.0675
BALB/cByJ f 0.2614 0.042 0.3439 0.1789
BALB/cByJ m 0.2957 0.042 0.3782 0.2132
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.1225 0.0393 0.1997 0.0453
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.1337 0.0393 0.2109 0.0566
BUB/BnJ f 0.1671 0.042 0.2497 0.0846
BUB/BnJ m 0.18 0.0453 0.2691 0.0909
C3H/HeJ f 0.1725 0.0393 0.2497 0.0953
C3H/HeJ m 0.2638 0.0393 0.3409 0.1866
C57BL/10J f 0.2189 0.037 0.2917 0.1461
C57BL/10J m 0.4238 0.0393 0.5009 0.3466
C57BL/6J f 0.21 0.042 0.2925 0.1275
C57BL/6J m 0.3067 0.0453 0.3958 0.2175
C57BLKS/J f 0.33 0.0393 0.4072 0.2528
C57BLKS/J m 0.3625 0.0393 0.4397 0.2853
C57BR/cdJ f 0.1762 0.0393 0.2534 0.0991
C57BR/cdJ m 0.2387 0.0393 0.3159 0.1616
C57L/J f 0.1125 0.0393 0.1897 0.0353
C57L/J m 0.3112 0.0393 0.3884 0.2341
CAST/EiJ f 0.245 0.0393 0.3222 0.1678
CAST/EiJ m 0.1833 0.0453 0.2725 0.0942
CBA/J f 0.0837 0.0393 0.1609 0.0066
CBA/J m 0.11 0.042 0.1925 0.0275
DBA/2J f 0.1425 0.0393 0.2197 0.0653
DBA/2J m 0.1243 0.042 0.2068 0.0418
FVB/NJ f 0.095 0.0393 0.1722 0.0178
FVB/NJ m 0.1375 0.0393 0.2147 0.0603
KK/HlJ f 0.1886 0.042 0.2711 0.1061
KK/HlJ m 0.3582 0.0335 0.424 0.2924
LP/J f 0.345 0.0393 0.4222 0.2678
LP/J m 0.3271 0.042 0.4097 0.2446
MRL/MpJ f 0.1538 0.0393 0.2309 0.0766
MRL/MpJ m 0.1813 0.0393 0.2584 0.1041
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.1563 0.0393 0.2334 0.0791
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.1613 0.0393 0.2384 0.0841
NON/ShiLtJ f 0.1589 0.037 0.2317 0.0861
NON/ShiLtJ m 0.2114 0.042 0.2939 0.1289
NZO/HlLtJ f 0.1667 0.0453 0.2558 0.0775
NZO/HlLtJ m 0.198 0.0497 0.2956 0.1004
NZW/LacJ f 0.0775 0.0393 0.1547 0.0003
NZW/LacJ m 0.0375 0.0393 0.1147 0.0
P/J f 0.0871 0.042 0.1697 0.0046
P/J m 0.4333 0.0641 0.5594 0.3073
PL/J f 0.2 0.042 0.2825 0.1175
PL/J m 0.2489 0.037 0.3217 0.1761
PWD/PhJ f 0.1675 0.0393 0.2447 0.0903
PWD/PhJ m 0.1538 0.0393 0.2309 0.0766
RIIIS/J f 0.0625 0.0393 0.1397 0.0
RIIIS/J m 0.0929 0.042 0.1754 0.0103
SJL/J f 0.6214 0.042 0.7039 0.5389
SJL/J m 0.3288 0.0393 0.4059 0.2516
SM/J f 0.0775 0.0393 0.1547 0.0003
SM/J m 0.1475 0.0393 0.2247 0.0703
SWR/J f 0.1757 0.042 0.2582 0.0932
SWR/J m 0.1763 0.0393 0.2534 0.0991
WSB/EiJ f 0.23 0.037 0.3028 0.1572
WSB/EiJ m 0.2488 0.0393 0.3259 0.1716


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.3274 0.0287 0.3839 0.2709
A/J both 0.1305 0.0309 0.1912 0.0698
BALB/cByJ both 0.2786 0.0297 0.3369 0.2202
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.1281 0.0278 0.1827 0.0735
BUB/BnJ both 0.1736 0.0309 0.2343 0.1128
C3H/HeJ both 0.2181 0.0278 0.2727 0.1635
C57BL/10J both 0.3213 0.027 0.3744 0.2683
C57BL/6J both 0.2583 0.0309 0.3191 0.1976
C57BLKS/J both 0.3463 0.0278 0.4008 0.2917
C57BR/cdJ both 0.2075 0.0278 0.2621 0.1529
C57L/J both 0.2119 0.0278 0.2665 0.1573
CAST/EiJ both 0.2142 0.03 0.2731 0.1552
CBA/J both 0.0969 0.0287 0.1534 0.0404
DBA/2J both 0.1334 0.0287 0.1899 0.0769
FVB/NJ both 0.1163 0.0278 0.1708 0.0617
KK/HlJ both 0.2734 0.0268 0.3262 0.2206
LP/J both 0.3361 0.0287 0.3926 0.2796
MRL/MpJ both 0.1675 0.0278 0.2221 0.1129
NOD.B10Sn-H2b/J both 0.1588 0.0278 0.2133 0.1042
NON/ShiLtJ both 0.1852 0.028 0.2402 0.1302
NZO/HlLtJ both 0.1823 0.0336 0.2484 0.1162
NZW/LacJ both 0.0575 0.0278 0.1121 0.0029
P/J both 0.2602 0.0383 0.3356 0.1849
PL/J both 0.2244 0.028 0.2795 0.1694
PWD/PhJ both 0.1606 0.0278 0.2152 0.106
RIIIS/J both 0.0777 0.0287 0.1342 0.0212
SJL/J both 0.4751 0.0287 0.5316 0.4186
SM/J both 0.1125 0.0278 0.1671 0.0579
SWR/J both 0.176 0.0287 0.2325 0.1195
WSB/EiJ both 0.2394 0.027 0.2924 0.1863




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS