Phenotype measure:   Peters4   EOS_M06

ID, description, units MPD:24321   EOS_M06   eosinophil count (EOS; units per volume x 103)   [n/µL]  at age 6mo
Data set, strains Peters4   inbred   30 strains     sex: both     age: 26wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Peters4 - eosinophil count (EOS; units per volume x 103) at age 6mo



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested30 strains30 strains
Mean of the strain means0.212   n/µL 0.215   n/µL
Median of the strain means0.205   n/µL 0.198   n/µL
SD of the strain means± 0.128 ± 0.104
Coefficient of variation (CV)0.603 0.483
Min–max range of strain means0.0750   –   0.689   n/µL 0.0688   –   0.473   n/µL
Mean sample size per strain7.7   mice 7.4   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0 0.0 0.002 0.9642
strain 29 4.7914 0.1652 8.9773 < 0.0001
sex:strain 29 1.124 0.0388 2.106 0.0009
Residuals 393 7.2329 0.0184


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.295 0.134   8 0.0473 0.453 0.07, 0.43 0.65
129S1/SvImJ m 0.196 0.138   12 0.0399 0.706 0.1, 0.61 -0.18
A/J f 0.2 0.12   5 0.0538 0.601 0.08, 0.38 -0.09
A/J m 0.24 0.252   8 0.089 1.05 0.08, 0.76 0.24
BALB/cByJ f 0.25 0.139   6 0.0566 0.554 0.14, 0.52 0.3
BALB/cByJ m 0.129 0.0906   8 0.032 0.704 0.03, 0.29 -0.83
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.166 0.093   8 0.0329 0.56 0.09, 0.38 -0.36
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.11 0.0214   8 0.00756 0.194 0.08, 0.14 -1.01
BUB/BnJ f 0.308 0.138   8 0.0487 0.448 0.13, 0.61 0.75
BUB/BnJ m 0.259 0.121   7 0.0456 0.467 0.12, 0.46 0.43
C3H/HeJ f 0.144 0.0282   7 0.0107 0.195 0.1, 0.17 -0.53
C3H/HeJ m 0.128 0.0183   8 0.00648 0.144 0.11, 0.16 -0.84
C57BL/10J f 0.273 0.0523   8 0.0185 0.192 0.2, 0.33 0.48
C57BL/10J m 0.337 0.107   6 0.0437 0.318 0.2, 0.53 1.18
C57BL/6J f 0.08 0.0469   8 0.0166 0.586 0.01, 0.16 -1.03
C57BL/6J m 0.313 0.0859   6 0.0351 0.274 0.23, 0.45 0.95
C57BLKS/J f 0.271 0.128   8 0.0453 0.473 0.13, 0.51 0.46
C57BLKS/J m 0.309 0.0925   7 0.0349 0.3 0.14, 0.42 0.91
C57BR/cdJ f 0.153 0.0502   7 0.019 0.329 0.09, 0.23 -0.46
C57BR/cdJ m 0.186 0.0342   8 0.0121 0.184 0.14, 0.25 -0.28
C57L/J f 0.121 0.0579   8 0.0205 0.478 -0.71
C57L/J m 0.169 0.0364   8 0.0129 0.216 0.11, 0.21 -0.44
CAST/EiJ f 0.264 0.117   10 0.0369 0.442 0.16, 0.57 0.41
CAST/EiJ m 0.155 0.00707   2   0.005 0.0456 0.15, 0.16 -0.58
CBA/J f 0.108 0.0549   6 0.0224 0.507 0.03, 0.17 -0.81
CBA/J m 0.0688 0.0323   8 0.0114 0.469 -1.41
DBA/2J f 0.25 0.0653   7 0.0247 0.261 0.17, 0.33 0.3
DBA/2J m 0.469 0.52   7 0.197 1.11 0.12, 1.57 2.45
FVB/NJ f 0.0937 0.0272   8 0.00962 0.29 0.06, 0.14 -0.93
FVB/NJ m 0.131 0.0717   7 0.0271 0.546 0.06, 0.27 -0.81
KK/HlJ f 0.243 0.185   6 0.0757 0.762 0.15, 0.62 0.24
KK/HlJ m 0.363 0.297   8 0.105 0.819 0.11, 1.03 1.43
LP/J f 0.483 0.251   6 0.103 0.52 0.19, 0.89 2.12
LP/J m 0.222 0.0354   8 0.0125 0.159 0.17, 0.28 0.07
MRL/MpJ f 0.101 0.0615   8 0.0217 0.608 -0.87
MRL/MpJ m 0.22 0.0663   5 0.0297 0.302 0.13, 0.29 0.05
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.129 0.0348   8 0.0123 0.27 0.09, 0.18 -0.65
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.151 0.0636   8 0.0225 0.42 0.09, 0.28 -0.61
NON/ShiLtJ f 0.156 0.0472   8 0.0167 0.302 0.11, 0.25 -0.44
NON/ShiLtJ m 0.227 0.0862   6 0.0352 0.38 0.13, 0.38 0.12
NZO/HlLtJ f 0.212 0.0611   8 0.0216 0.288 0.13, 0.28 0.0
NZO/HlLtJ m 0.161 0.0434   7 0.0164 0.269 0.11, 0.23 -0.52
NZW/LacJ f 0.169 0.132   8 0.0468 0.784 0.04, 0.37 -0.34
NZW/LacJ m 0.145 0.0683   6 0.0279 0.471 0.07, 0.26 -0.67
P/J f 0.0763 0.0297   8 0.0105 0.39 0.04, 0.12 -1.06
P/J m 0.158 0.0717   8 0.0253 0.455 0.08, 0.31 -0.55
PL/J f 0.24 0.191   13 0.0529 0.794 0.1, 0.83 0.22
PL/J m 0.211 0.0514   8 0.0182 0.243 0.15, 0.31 -0.04
PWD/PhJ f 0.209 0.0562   8 0.0199 0.269 0.14, 0.31 -0.02
PWD/PhJ m 0.2 0.094   7 0.0355 0.47 0.12, 0.38 -0.14
RIIIS/J f 0.075 0.016   8 0.00567 0.214 0.05, 0.1 -1.07
RIIIS/J m 0.095 0.0185   8 0.00655 0.195 0.07, 0.13 -1.15
SJL/J f 0.689 0.342   8 0.121 0.496 0.23, 1.32 3.73
SJL/J m 0.473 0.217   8 0.0768 0.459 0.1, 0.71 2.49
SM/J f 0.095 0.0259   6 0.0106 0.272 0.06, 0.12 -0.92
SM/J m 0.08 0.0283   8 0.01 0.354 0.06, 0.12 -1.3
SWR/J f 0.215 0.131   8 0.0464 0.61 0.08, 0.48 0.02
SWR/J m 0.206 0.138   8 0.0487 0.668 0.09, 0.48 -0.08
WSB/EiJ f 0.294 0.156   10 0.0492 0.529 0.13, 0.69 0.64
WSB/EiJ m 0.331 0.151   7 0.0573 0.457 0.1, 0.58 1.12


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.295 0.048 0.3893 0.2007
129S1/SvImJ m 0.1958 0.0392 0.2728 0.1188
A/J f 0.2 0.0607 0.3193 0.0807
A/J m 0.24 0.048 0.3343 0.1457
BALB/cByJ f 0.25 0.0554 0.3589 0.1411
BALB/cByJ m 0.1287 0.048 0.223 0.0345
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.1662 0.048 0.2605 0.072
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.11 0.048 0.2043 0.0157
BUB/BnJ f 0.3075 0.048 0.4018 0.2132
BUB/BnJ m 0.2586 0.0513 0.3594 0.1578
C3H/HeJ f 0.1443 0.0513 0.2451 0.0435
C3H/HeJ m 0.1275 0.048 0.2218 0.0332
C57BL/10J f 0.2725 0.048 0.3668 0.1782
C57BL/10J m 0.3367 0.0554 0.4456 0.2278
C57BL/6J f 0.08 0.048 0.1743 0.0
C57BL/6J m 0.3133 0.0554 0.4222 0.2044
C57BLKS/J f 0.2713 0.048 0.3655 0.177
C57BLKS/J m 0.3086 0.0513 0.4094 0.2078
C57BR/cdJ f 0.1529 0.0513 0.2537 0.052
C57BR/cdJ m 0.1863 0.048 0.2805 0.092
C57L/J f 0.1213 0.048 0.2155 0.027
C57L/J m 0.1688 0.048 0.263 0.0745
CAST/EiJ f 0.264 0.0429 0.3483 0.1797
CAST/EiJ m 0.155 0.0959 0.3436 0.0
CBA/J f 0.1083 0.0554 0.2172 0.0
CBA/J m 0.0688 0.048 0.163 0.0
DBA/2J f 0.25 0.0513 0.3508 0.1492
DBA/2J m 0.4686 0.0513 0.5694 0.3678
FVB/NJ f 0.0938 0.048 0.188 0.0
FVB/NJ m 0.1314 0.0513 0.2322 0.0306
KK/HlJ f 0.2433 0.0554 0.3522 0.1344
KK/HlJ m 0.3625 0.048 0.4568 0.2682
LP/J f 0.4833 0.0554 0.5922 0.3744
LP/J m 0.2225 0.048 0.3168 0.1282
MRL/MpJ f 0.1012 0.048 0.1955 0.007
MRL/MpJ m 0.22 0.0607 0.3393 0.1007
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.1288 0.048 0.223 0.0345
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.1513 0.048 0.2455 0.057
NON/ShiLtJ f 0.1563 0.048 0.2505 0.062
NON/ShiLtJ m 0.2267 0.0554 0.3356 0.1178
NZO/HlLtJ f 0.2125 0.048 0.3068 0.1182
NZO/HlLtJ m 0.1614 0.0513 0.2622 0.0606
NZW/LacJ f 0.1688 0.048 0.263 0.0745
NZW/LacJ m 0.145 0.0554 0.2539 0.0361
P/J f 0.0763 0.048 0.1705 0.0
P/J m 0.1575 0.048 0.2518 0.0632
PL/J f 0.24 0.0376 0.314 0.166
PL/J m 0.2113 0.048 0.3055 0.117
PWD/PhJ f 0.2088 0.048 0.303 0.1145
PWD/PhJ m 0.2 0.0513 0.3008 0.0992
RIIIS/J f 0.075 0.048 0.1693 0.0
RIIIS/J m 0.095 0.048 0.1893 0.0007
SJL/J f 0.6887 0.048 0.783 0.5945
SJL/J m 0.4725 0.048 0.5668 0.3782
SM/J f 0.095 0.0554 0.2039 0.0
SM/J m 0.08 0.048 0.1743 0.0
SWR/J f 0.215 0.048 0.3093 0.1207
SWR/J m 0.2063 0.048 0.3005 0.112
WSB/EiJ f 0.294 0.0429 0.3783 0.2097
WSB/EiJ m 0.3314 0.0513 0.4322 0.2306


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.2454 0.031 0.3063 0.1845
A/J both 0.22 0.0387 0.296 0.144
BALB/cByJ both 0.1894 0.0366 0.2614 0.1174
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.1381 0.0339 0.2048 0.0714
BUB/BnJ both 0.283 0.0351 0.3521 0.214
C3H/HeJ both 0.1359 0.0351 0.2049 0.0669
C57BL/10J both 0.3046 0.0366 0.3766 0.2326
C57BL/6J both 0.1967 0.0366 0.2687 0.1246
C57BLKS/J both 0.2899 0.0351 0.3589 0.2209
C57BR/cdJ both 0.1696 0.0351 0.2386 0.1005
C57L/J both 0.145 0.0339 0.2117 0.0783
CAST/EiJ both 0.2095 0.0525 0.3128 0.1062
CBA/J both 0.0885 0.0366 0.1606 0.0165
DBA/2J both 0.3593 0.0363 0.4306 0.288
FVB/NJ both 0.1126 0.0351 0.1816 0.0436
KK/HlJ both 0.3029 0.0366 0.3749 0.2309
LP/J both 0.3529 0.0366 0.4249 0.2809
MRL/MpJ both 0.1606 0.0387 0.2367 0.0846
NOD.B10Sn-H2b/J both 0.14 0.0339 0.2067 0.0733
NON/ShiLtJ both 0.1915 0.0366 0.2635 0.1194
NZO/HlLtJ both 0.187 0.0351 0.256 0.1179
NZW/LacJ both 0.1569 0.0366 0.2289 0.0849
P/J both 0.1169 0.0339 0.1836 0.0502
PL/J both 0.2256 0.0305 0.2856 0.1657
PWD/PhJ both 0.2044 0.0351 0.2734 0.1354
RIIIS/J both 0.085 0.0339 0.1517 0.0183
SJL/J both 0.5806 0.0339 0.6473 0.5139
SM/J both 0.0875 0.0366 0.1595 0.0155
SWR/J both 0.2106 0.0339 0.2773 0.1439
WSB/EiJ both 0.3127 0.0334 0.3784 0.247




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS