Project measure / variable:   Peters4   MONO_M18

ID, description, units MPD:24319   MONO_M18   monocyte count (MONO; units per volume x 103)   [n/µL]  at age 18mo  
Data set, strains Peters4   inbred   30 strains     sex: both     age: 78wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Peters4 - monocyte count (MONO; units per volume x 103) at age 18mo



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested28 strains29 strains
Mean of the strain means0.244   n/µL 0.345   n/µL
Median of the strain means0.245   n/µL 0.320   n/µL
SD of the strain means± 0.117 ± 0.162
Coefficient of variation (CV)0.478 0.471
Min–max range of strain means0.0514   –   0.543   n/µL 0.0925   –   0.774   n/µL
Mean sample size per strain7.0   mice 7.7   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.72 0.72 29.1503 < 0.0001
strain 26 5.3805 0.2069 8.3783 < 0.0001
sex:strain 26 0.9779 0.0376 1.5228 0.0516
Residuals 334 8.2497 0.0247


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.258 0.116   8 0.041 0.45 0.13, 0.44 0.12
129S1/SvImJ m 0.531 0.181   7 0.0683 0.34 0.29, 0.86 1.15
A/J f 0.274 0.147   7 0.0557 0.537 0.13, 0.59 0.25
A/J m 0.389 0.18   15 0.0465 0.463 0.06, 0.78 0.27
BALB/cByJ f 0.212 0.106   8 0.0374 0.498 0.06, 0.37 -0.28
BALB/cByJ m 0.29 0.148   7 0.0559 0.51 0.04, 0.46 -0.34
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.238 0.0886   8 0.0313 0.373 0.12, 0.36 -0.05
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.32 0.127   6 0.0519 0.397 0.09, 0.43 -0.15
BUB/BnJ f 0.196 0.0699   5 0.0312 0.356 0.12, 0.31 -0.41
BUB/BnJ m 0.217 0.0683   6 0.0279 0.315 0.1, 0.28 -0.79
C3H/HeJ f 0.253 0.176   7 0.0665 0.696 0.05, 0.59 0.07
C3H/HeJ m 0.366 0.183   8 0.0648 0.5 0.2, 0.62 0.13
C57BL/10J f 0.543 0.378   7 0.143 0.696 0.16, 1.26 2.56
C57BL/10J m 0.575 0.423   13 0.117 0.735 0.17, 1.84 1.42
C57BL/6J f 0.157 0.0716   7 0.0271 0.456 0.07, 0.27 -0.75
C57BL/6J m 0.259 0.256   7 0.0969 0.992 0.11, 0.83 -0.53
C57BLKS/J m 0.447 0.123   16 0.0307 0.274 0.2, 0.69 0.63
C57BR/cdJ f 0.391 0.189   8 0.067 0.484 0.1, 0.68 1.25
C57BR/cdJ m 0.355 0.132   8 0.0468 0.372 0.21, 0.63 0.06
C57L/J f 0.297 0.105   7 0.0396 0.353 0.15, 0.41 0.45
C57L/J m 0.509 0.144   7 0.0545 0.283 0.25, 0.73 1.01
CAST/EiJ f 0.216 0.0553   8 0.0195 0.256 0.12, 0.28 -0.24
CBA/J f 0.165 0.0495   2   0.035 0.3 0.13, 0.2 -0.68
CBA/J m 0.154 0.0713   5 0.0319 0.463 0.05, 0.21 -1.18
DBA/2J f 0.28 0.142   6 0.0581 0.509 0.09, 0.42 0.3
DBA/2J m 0.68 0.164   6 0.0669 0.241 0.48, 0.88 2.07
FVB/NJ f 0.193 0.113   7 0.0426 0.585 0.03, 0.4 -0.44
FVB/NJ m 0.164 0.0868   12 0.0251 0.529 0.03, 0.34 -1.11
KK/HlJ f 0.285 0.0896   6 0.0366 0.314 0.22, 0.46 0.35
KK/HlJ m 0.313 0.121   7 0.0457 0.386 0.19, 0.55 -0.19
LP/J m 0.774 0.171   8 0.0603 0.22 0.41, 0.94 2.65
MRL/MpJ f 0.0514 0.038   7 0.0144 0.74 0.01, 0.13 -1.65
MRL/MpJ m 0.198 0.0671   8 0.0237 0.34 0.06, 0.28 -0.9
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.263 0.1   7 0.0379 0.382 0.13, 0.44 0.16
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.354 0.0723   7 0.0273 0.204 0.21, 0.45 0.06
NON/ShiLtJ f 0.498 0.137   5 0.0611 0.274 0.39, 0.68 2.17
NON/ShiLtJ m 0.299 0.14   7 0.0528 0.468 0.05, 0.44 -0.28
NZO/HlLtJ f 0.296 0.0991   10 0.0313 0.335 0.15, 0.47 0.44
NZO/HlLtJ m 0.41 0.0283   2   0.02 0.069 0.39, 0.43 0.4
NZW/LacJ f 0.377 0.107   7 0.0405 0.284 0.26, 0.5 1.14
NZW/LacJ m 0.418 0.117   6 0.0477 0.279 0.3, 0.63 0.45
P/J f 0.0671 0.0298   7 0.0113 0.444 0.03, 0.12 -1.52
P/J m 0.172 0.175   5 0.0784 1.02 0.05, 0.48 -1.06
PL/J f 0.264 0.132   8 0.0466 0.5 0.09, 0.51 0.17
PL/J m 0.385 0.321   8 0.113 0.833 0.06, 1.07 0.25
PWD/PhJ f 0.19 0.0329   6 0.0134 0.173 0.15, 0.25 -0.47
PWD/PhJ m 0.241 0.0684   7 0.0259 0.283 0.17, 0.34 -0.64
RIIIS/J f 0.113 0.0354   8 0.0125 0.314 0.07, 0.17 -1.12
RIIIS/J m 0.191 0.0383   8 0.0136 0.2 0.14, 0.27 -0.95
SJL/J f 0.0586 0.0313   7 0.0118 0.535 0.02, 0.11 -1.59
SJL/J m 0.0925 0.0718   4 0.0359 0.776 0.05, 0.2 -1.55
SM/J f 0.187 0.0423   6 0.0173 0.226 0.12, 0.23 -0.49
SM/J m 0.302 0.0769   9 0.0256 0.255 0.22, 0.43 -0.26
SWR/J f 0.166 0.0629   7 0.0238 0.38 0.07, 0.24 -0.67
SWR/J m 0.144 0.0637   8 0.0225 0.443 0.05, 0.25 -1.24
WSB/EiJ f 0.354 0.115   8 0.0407 0.325 0.22, 0.55 0.94
WSB/EiJ m 0.444 0.171   9 0.057 0.384 0.17, 0.72 0.61


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.2575 0.0556 0.3668 0.1482
129S1/SvImJ m 0.5314 0.0594 0.6483 0.4146
A/J f 0.2743 0.0594 0.3911 0.1574
A/J m 0.3887 0.0406 0.4685 0.3088
BALB/cByJ f 0.2125 0.0556 0.3218 0.1032
BALB/cByJ m 0.29 0.0594 0.4068 0.1732
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.2375 0.0556 0.3468 0.1282
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.32 0.0642 0.4462 0.1938
BUB/BnJ f 0.196 0.0703 0.3343 0.0577
BUB/BnJ m 0.2167 0.0642 0.3429 0.0905
C3H/HeJ f 0.2529 0.0594 0.3697 0.136
C3H/HeJ m 0.3662 0.0556 0.4756 0.2569
C57BL/10J f 0.5429 0.0594 0.6597 0.426
C57BL/10J m 0.5754 0.0436 0.6611 0.4896
C57BL/6J f 0.1571 0.0594 0.274 0.0403
C57BL/6J m 0.2586 0.0594 0.3754 0.1417
C57BR/cdJ f 0.3913 0.0556 0.5006 0.2819
C57BR/cdJ m 0.355 0.0556 0.4643 0.2457
C57L/J f 0.2971 0.0594 0.414 0.1803
C57L/J m 0.5086 0.0594 0.6254 0.3917
CBA/J f 0.165 0.1111 0.3836 0.0
CBA/J m 0.154 0.0703 0.2923 0.0157
DBA/2J f 0.28 0.0642 0.4062 0.1538
DBA/2J m 0.68 0.0642 0.8062 0.5538
FVB/NJ f 0.1929 0.0594 0.3097 0.076
FVB/NJ m 0.1642 0.0454 0.2534 0.0749
KK/HlJ f 0.285 0.0642 0.4112 0.1588
KK/HlJ m 0.3129 0.0594 0.4297 0.196
MRL/MpJ f 0.0514 0.0594 0.1683 0.0
MRL/MpJ m 0.1975 0.0556 0.3068 0.0882
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.2629 0.0594 0.3797 0.146
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.3543 0.0594 0.4711 0.2374
NON/ShiLtJ f 0.498 0.0703 0.6363 0.3597
NON/ShiLtJ m 0.2986 0.0594 0.4154 0.1817
NZO/HlLtJ f 0.296 0.0497 0.3938 0.1982
NZO/HlLtJ m 0.41 0.1111 0.6286 0.1914
NZW/LacJ f 0.3771 0.0594 0.494 0.2603
NZW/LacJ m 0.4183 0.0642 0.5445 0.2921
P/J f 0.0671 0.0594 0.184 0.0
P/J m 0.172 0.0703 0.3103 0.0337
PL/J f 0.2637 0.0556 0.3731 0.1544
PL/J m 0.385 0.0556 0.4943 0.2757
PWD/PhJ f 0.19 0.0642 0.3162 0.0638
PWD/PhJ m 0.2414 0.0594 0.3583 0.1246
RIIIS/J f 0.1125 0.0556 0.2218 0.0032
RIIIS/J m 0.1912 0.0556 0.3006 0.0819
SJL/J f 0.0586 0.0594 0.1754 0.0
SJL/J m 0.0925 0.0786 0.2471 0.0
SM/J f 0.1867 0.0642 0.3129 0.0605
SM/J m 0.3022 0.0524 0.4053 0.1992
SWR/J f 0.1657 0.0594 0.2826 0.0489
SWR/J m 0.1437 0.0556 0.2531 0.0344
WSB/EiJ f 0.3537 0.0556 0.4631 0.2444
WSB/EiJ m 0.4444 0.0524 0.5475 0.3414


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.3945 0.0407 0.4745 0.3145
A/J both 0.3315 0.036 0.4022 0.2607
BALB/cByJ both 0.2512 0.0407 0.3313 0.1712
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.2787 0.0424 0.3622 0.1953
BUB/BnJ both 0.2063 0.0476 0.2999 0.1127
C3H/HeJ both 0.3096 0.0407 0.3896 0.2296
C57BL/10J both 0.5591 0.0368 0.6316 0.4867
C57BL/6J both 0.2079 0.042 0.2905 0.1252
C57BR/cdJ both 0.3731 0.0393 0.4504 0.2958
C57L/J both 0.4029 0.042 0.4855 0.3202
CBA/J both 0.1595 0.0657 0.2888 0.0302
DBA/2J both 0.48 0.0454 0.5692 0.3908
FVB/NJ both 0.1785 0.0374 0.252 0.105
KK/HlJ both 0.2989 0.0437 0.3849 0.2129
MRL/MpJ both 0.1245 0.0407 0.2045 0.0445
NOD.B10Sn-H2b/J both 0.3086 0.042 0.3912 0.2259
NON/ShiLtJ both 0.3983 0.046 0.4888 0.3078
NZO/HlLtJ both 0.353 0.0609 0.4727 0.2333
NZW/LacJ both 0.3977 0.0437 0.4837 0.3117
P/J both 0.1196 0.046 0.2101 0.0291
PL/J both 0.3244 0.0393 0.4017 0.2471
PWD/PhJ both 0.2157 0.0437 0.3017 0.1297
RIIIS/J both 0.1519 0.0393 0.2292 0.0746
SJL/J both 0.0755 0.0493 0.1724 0.0
SM/J both 0.2444 0.0414 0.3259 0.163
SWR/J both 0.1547 0.0407 0.2347 0.0747
WSB/EiJ both 0.3991 0.0382 0.4742 0.324




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS