Project measure / variable:   Peters4   MONO_M06

ID, description, units MPD:24317   MONO_M06   monocyte count (MONO; units per volume x 103)   [n/µL]  at age 6mo  
Data set, strains Peters4   inbred   30 strains     sex: both     age: 26wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Peters4 - monocyte count (MONO; units per volume x 103) at age 6mo



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested30 strains30 strains
Mean of the strain means0.193   n/µL 0.244   n/µL
Median of the strain means0.171   n/µL 0.221   n/µL
SD of the strain means± 0.102 ± 0.116
Coefficient of variation (CV)0.527 0.477
Min–max range of strain means0.0475   –   0.383   n/µL 0.0700   –   0.612   n/µL
Mean sample size per strain7.6   mice 7.3   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.2654 0.2654 30.295 < 0.0001
strain 29 4.0668 0.1402 16.007 < 0.0001
sex:strain 29 0.9672 0.0334 3.8068 < 0.0001
Residuals 391 3.4255 0.0088


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.169 0.0372   8 0.0132 0.22 0.12, 0.23 -0.24
129S1/SvImJ m 0.178 0.0369   12 0.0106 0.207 0.12, 0.24 -0.57
A/J f 0.136 0.0594   5 0.0266 0.437 0.06, 0.2 -0.56
A/J m 0.202 0.0158   8 0.00559 0.0781 0.17, 0.22 -0.36
BALB/cByJ f 0.208 0.0337   6 0.0138 0.162 0.16, 0.24 0.15
BALB/cByJ m 0.146 0.104   8 0.0368 0.711 0.02, 0.27 -0.84
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.223 0.0515   8 0.0182 0.231 0.16, 0.31 0.29
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.335 0.0715   8 0.0253 0.213 0.24, 0.46 0.79
BUB/BnJ f 0.0912 0.0217   8 0.00766 0.237 0.06, 0.12 -1.0
BUB/BnJ m 0.119 0.0241   7 0.00911 0.203 0.07, 0.14 -1.07
C3H/HeJ f 0.209 0.0604   7 0.0228 0.29 0.13, 0.31 0.16
C3H/HeJ m 0.23 0.0454   8 0.016 0.197 0.15, 0.29 -0.12
C57BL/10J f 0.355 0.0983   8 0.0347 0.277 0.2, 0.47 1.59
C57BL/10J m 0.242 0.0873   6 0.0356 0.361 0.15, 0.38 -0.01
C57BL/6J f 0.0787 0.0236   8 0.00833 0.299 0.05, 0.12 -1.12
C57BL/6J m 0.18 0.119   6 0.0487 0.663 0.1, 0.41 -0.55
C57BLKS/J f 0.205 0.0873   8 0.0309 0.426 0.13, 0.38 0.12
C57BLKS/J m 0.274 0.0616   7 0.0233 0.225 0.19, 0.35 0.26
C57BR/cdJ f 0.174 0.0428   7 0.0162 0.245 0.13, 0.26 -0.19
C57BR/cdJ m 0.194 0.04   8 0.0141 0.206 0.14, 0.25 -0.43
C57L/J f 0.36 0.415   8 0.147 1.15 0.14, 1.38 1.64
C57L/J m 0.189 0.0422   8 0.0149 0.224 0.14, 0.24 -0.47
CAST/EiJ f 0.159 0.0795   10 0.0251 0.5 0.08, 0.35 -0.34
CAST/EiJ m 0.165 0.106   2   0.075 0.643 0.09, 0.24 -0.68
CBA/J f 0.08 0.0167   6 0.00683 0.209 0.06, 0.11 -1.11
CBA/J m 0.24 0.0746   7 0.0282 0.311 0.15, 0.36 -0.03
DBA/2J f 0.31 0.0614   7 0.0232 0.198 0.2, 0.37 1.15
DBA/2J m 0.386 0.143   7 0.0541 0.371 0.24, 0.66 1.23
FVB/NJ f 0.155 0.0444   8 0.0157 0.286 0.09, 0.23 -0.37
FVB/NJ m 0.197 0.0602   7 0.0228 0.305 0.11, 0.29 -0.4
KK/HlJ f 0.288 0.0549   6 0.0224 0.19 0.23, 0.36 0.93
KK/HlJ m 0.277 0.0506   8 0.0179 0.182 0.22, 0.35 0.29
LP/J f 0.383 0.21   6 0.0857 0.547 0.17, 0.76 1.86
LP/J m 0.443 0.146   8 0.0515 0.329 0.23, 0.68 1.72
MRL/MpJ f 0.114 0.0428   7 0.0162 0.374 0.05, 0.16 -0.78
MRL/MpJ m 0.228 0.0192   5 0.0086 0.0844 0.21, 0.26 -0.13
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.244 0.0744   8 0.0263 0.305 0.13, 0.36 0.5
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.381 0.105   8 0.0372 0.276 0.23, 0.53 1.18
NON/ShiLtJ f 0.374 0.109   8 0.0386 0.292 0.21, 0.5 1.78
NON/ShiLtJ m 0.347 0.0814   6 0.0332 0.235 0.21, 0.45 0.89
NZO/HlLtJ f 0.312 0.0243   8 0.00861 0.0779 0.27, 0.34 1.17
NZO/HlLtJ m 0.276 0.0757   7 0.0286 0.275 0.16, 0.41 0.28
NZW/LacJ f 0.27 0.0382   8 0.0135 0.141 0.21, 0.32 0.75
NZW/LacJ m 0.612 0.139   6 0.0568 0.228 0.38, 0.75 3.17
P/J f 0.0475 0.0149   8 0.00526 0.313 0.03, 0.08 -1.43
P/J m 0.227 0.241   8 0.0853 1.06 0.1, 0.82 -0.14
PL/J f 0.253 0.0787   13 0.0218 0.311 0.13, 0.4 0.59
PL/J m 0.396 0.0484   8 0.0171 0.122 0.33, 0.49 1.31
PWD/PhJ f 0.08 0.0131   8 0.00463 0.164 0.06, 0.1 -1.11
PWD/PhJ m 0.153 0.103   7 0.039 0.674 0.06, 0.37 -0.78
RIIIS/J f 0.0612 0.0136   8 0.00479 0.221 0.04, 0.08 -1.3
RIIIS/J m 0.111 0.0196   8 0.00693 0.176 0.07, 0.13 -1.14
SJL/J f 0.0963 0.0226   8 0.008 0.235 0.05, 0.12 -0.95
SJL/J m 0.0912 0.0203   8 0.00718 0.223 0.05, 0.11 -1.31
SM/J f 0.137 0.0197   6 0.00803 0.144 0.1, 0.15 -0.55
SM/J m 0.215 0.0355   8 0.0125 0.165 0.14, 0.26 -0.25
SWR/J f 0.095 0.0374   8 0.0132 0.394 0.06, 0.15 -0.96
SWR/J m 0.07 0.0239   8 0.00845 0.341 0.04, 0.11 -1.5
WSB/EiJ f 0.127 0.0457   10 0.0145 0.36 0.06, 0.19 -0.65
WSB/EiJ m 0.206 0.0509   7 0.0193 0.248 0.16, 0.29 -0.32


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.1688 0.0331 0.2338 0.1037
129S1/SvImJ m 0.1783 0.027 0.2315 0.1252
A/J f 0.136 0.0419 0.2183 0.0537
A/J m 0.2025 0.0331 0.2676 0.1374
BALB/cByJ f 0.2083 0.0382 0.2835 0.1332
BALB/cByJ m 0.1462 0.0331 0.2113 0.0812
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.2225 0.0331 0.2876 0.1574
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.335 0.0331 0.4001 0.2699
BUB/BnJ f 0.0912 0.0331 0.1563 0.0262
BUB/BnJ m 0.1186 0.0354 0.1881 0.049
C3H/HeJ f 0.2086 0.0354 0.2781 0.139
C3H/HeJ m 0.23 0.0331 0.2951 0.1649
C57BL/10J f 0.355 0.0331 0.4201 0.2899
C57BL/10J m 0.2417 0.0382 0.3168 0.1665
C57BL/6J f 0.0787 0.0331 0.1438 0.0137
C57BL/6J m 0.18 0.0382 0.2551 0.1049
C57BLKS/J f 0.205 0.0331 0.2701 0.1399
C57BLKS/J m 0.2743 0.0354 0.3438 0.2047
C57BR/cdJ f 0.1743 0.0354 0.2438 0.1047
C57BR/cdJ m 0.1937 0.0331 0.2588 0.1287
C57L/J f 0.36 0.0331 0.4251 0.2949
C57L/J m 0.1888 0.0331 0.2538 0.1237
CAST/EiJ f 0.159 0.0296 0.2172 0.1008
CAST/EiJ m 0.165 0.0662 0.2951 0.0349
CBA/J f 0.08 0.0382 0.1551 0.0049
CBA/J m 0.24 0.0354 0.3096 0.1704
DBA/2J f 0.31 0.0354 0.3796 0.2404
DBA/2J m 0.3857 0.0354 0.4553 0.3162
FVB/NJ f 0.155 0.0331 0.2201 0.0899
FVB/NJ m 0.1971 0.0354 0.2667 0.1276
KK/HlJ f 0.2883 0.0382 0.3635 0.2132
KK/HlJ m 0.2775 0.0331 0.3426 0.2124
LP/J f 0.3833 0.0382 0.4585 0.3082
LP/J m 0.4425 0.0331 0.5076 0.3774
MRL/MpJ f 0.1143 0.0354 0.1838 0.0447
MRL/MpJ m 0.228 0.0419 0.3103 0.1457
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.2438 0.0331 0.3088 0.1787
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.3812 0.0331 0.4463 0.3162
NON/ShiLtJ f 0.3737 0.0331 0.4388 0.3087
NON/ShiLtJ m 0.3467 0.0382 0.4218 0.2715
NZO/HlLtJ f 0.3125 0.0331 0.3776 0.2474
NZO/HlLtJ m 0.2757 0.0354 0.3453 0.2062
NZW/LacJ f 0.27 0.0331 0.3351 0.2049
NZW/LacJ m 0.6117 0.0382 0.6868 0.5365
P/J f 0.0475 0.0331 0.1126 0.0
P/J m 0.2275 0.0331 0.2926 0.1624
PL/J f 0.2531 0.026 0.3041 0.202
PL/J m 0.3962 0.0331 0.4613 0.3312
PWD/PhJ f 0.08 0.0331 0.1451 0.0149
PWD/PhJ m 0.1529 0.0354 0.2224 0.0833
RIIIS/J f 0.0612 0.0331 0.1263 0.0
RIIIS/J m 0.1112 0.0331 0.1763 0.0462
SJL/J f 0.0963 0.0331 0.1613 0.0312
SJL/J m 0.0913 0.0331 0.1563 0.0262
SM/J f 0.1367 0.0382 0.2118 0.0615
SM/J m 0.215 0.0331 0.2801 0.1499
SWR/J f 0.095 0.0331 0.1601 0.0299
SWR/J m 0.07 0.0331 0.1351 0.0049
WSB/EiJ f 0.127 0.0296 0.1852 0.0688
WSB/EiJ m 0.2057 0.0354 0.2753 0.1362


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.1735 0.0214 0.2155 0.1315
A/J both 0.1692 0.0267 0.2217 0.1168
BALB/cByJ both 0.1773 0.0253 0.227 0.1276
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.2787 0.0234 0.3248 0.2327
BUB/BnJ both 0.1049 0.0242 0.1525 0.0573
C3H/HeJ both 0.2193 0.0242 0.2669 0.1717
C57BL/10J both 0.2983 0.0253 0.348 0.2486
C57BL/6J both 0.1294 0.0253 0.1791 0.0797
C57BLKS/J both 0.2396 0.0242 0.2873 0.192
C57BR/cdJ both 0.184 0.0242 0.2316 0.1364
C57L/J both 0.2744 0.0234 0.3204 0.2284
CAST/EiJ both 0.162 0.0363 0.2333 0.0907
CBA/J both 0.16 0.026 0.2112 0.1088
DBA/2J both 0.3479 0.025 0.397 0.2987
FVB/NJ both 0.1761 0.0242 0.2237 0.1285
KK/HlJ both 0.2829 0.0253 0.3326 0.2332
LP/J both 0.4129 0.0253 0.4626 0.3632
MRL/MpJ both 0.1711 0.0274 0.225 0.1173
NOD.B10Sn-H2b/J both 0.3125 0.0234 0.3585 0.2665
NON/ShiLtJ both 0.3602 0.0253 0.4099 0.3105
NZO/HlLtJ both 0.2941 0.0242 0.3417 0.2465
NZW/LacJ both 0.4408 0.0253 0.4905 0.3911
P/J both 0.1375 0.0234 0.1835 0.0915
PL/J both 0.3247 0.021 0.366 0.2833
PWD/PhJ both 0.1164 0.0242 0.164 0.0688
RIIIS/J both 0.0862 0.0234 0.1323 0.0402
SJL/J both 0.0938 0.0234 0.1398 0.0477
SM/J both 0.1758 0.0253 0.2255 0.1261
SWR/J both 0.0825 0.0234 0.1285 0.0365
WSB/EiJ both 0.1664 0.0231 0.2117 0.121




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS