Project measure / variable:   Project1124   Robinsoniella_pre

ID, description, units MPD:115054   Robinsoniella_pre   Robinsoniella   [%]  pre  
cocaine study
Data set, strains Project1124   CC   44 strains     sex: both
Procedure 16S rRNA Sequencing
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
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Project1124 - Robinsoniella pre



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested38 strains35 strains
Mean of the strain means0.20442   % 0.21066   %
Median of the strain means0.06579   % 0.07401   %
SD of the strain means± 0.42512 ± 0.55193
Coefficient of variation (CV)2.0797 2.62
Min–max range of strain means0.0   –   2.4867   % 0.0   –   3.2973   %
Mean sample size per strain1.0   mice 1.0   mice


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
CC001/UncJ f 0.01369 0.0   1   0.0 0.0 0.01369, 0.01369 -0.45
CC002/UncJ f 0.1124 0.0   1   0.0 0.0 0.1124, 0.1124 -0.22
CC002/UncJ m 0.25321 0.0   1   0.0 0.0 0.25321, 0.25321 0.08
CC003/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC004/TauUncJ f 0.01263 0.0   1   0.0 0.0 0.01263, 0.01263 -0.45
CC005/TauUncJ f 0.1685 0.0   1   0.0 0.0 0.1685, 0.1685 -0.08
CC005/TauUncJ m 0.14152 0.0   1   0.0 0.0 0.14152, 0.14152 -0.13
CC006/TauUncJ f 0.01563 0.0   1   0.0 0.0 0.01563, 0.01563 -0.44
CC006/TauUncJ m 0.11818 0.0   1   0.0 0.0 0.11818, 0.11818 -0.17
CC007/UncJ f 0.69478 0.0   1   0.0 0.0 0.69478, 0.69478 1.15
CC008/GeniUncJ f 0.04948 0.0   1   0.0 0.0 0.04948, 0.04948 -0.36
CC008/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC009/UncJ f 0.0218 0.0   1   0.0 0.0 0.0218, 0.0218 -0.43
CC009/UncJ m 0.19251 0.0   1   0.0 0.0 0.19251, 0.19251 -0.03
CC010/GeniUncJ m 0.05821 0.0   1   0.0 0.0 0.05821, 0.05821 -0.28
CC011/UncJ f 0.45981 0.0   1   0.0 0.0 0.45981, 0.45981 0.6
CC011/UncJ m 0.30531 0.0   1   0.0 0.0 0.30531, 0.30531 0.17
CC012/GeniUncJ f 0.01809 0.0   1   0.0 0.0 0.01809, 0.01809 -0.44
CC012/GeniUncJ m 0.16724 0.0   1   0.0 0.0 0.16724, 0.16724 -0.08
CC013/GeniUncJ f 0.13194 0.0   1   0.0 0.0 0.13194, 0.13194 -0.17
CC013/GeniUncJ m 0.27428 0.0   1   0.0 0.0 0.27428, 0.27428 0.12
CC016/GeniUncJ f 0.15838 0.0   1   0.0 0.0 0.15838, 0.15838 -0.11
CC017/UncJ m 0.0119 0.0   1   0.0 0.0 0.0119, 0.0119 -0.36
CC018/UncJ f 2.4867 0.0   1   0.0 0.0 2.4867, 2.4867 5.37
CC018/UncJ m 3.2973 0.0   1   0.0 0.0 3.2973, 3.2973 5.59
CC019/TauUncJ m 0.0418 0.0   1   0.0 0.0 0.0418, 0.0418 -0.31
CC020/GeniUncJ f 0.39376 0.0   1   0.0 0.0 0.39376, 0.39376 0.45
CC020/GeniUncJ m 0.07401 0.0   1   0.0 0.0 0.07401, 0.07401 -0.25
CC023/GeniUncJ f 0.12322 0.0   1   0.0 0.0 0.12322, 0.12322 -0.19
CC023/GeniUncJ m 0.08766 0.0   1   0.0 0.0 0.08766, 0.08766 -0.22
CC024/GeniUncJ m 0.3141 0.0   1   0.0 0.0 0.3141, 0.3141 0.19
CC026/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.48
CC026/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC027/GeniUncJ f 0.23735 0.0   1   0.0 0.0 0.23735, 0.23735 0.08
CC027/GeniUncJ m 0.13477 0.0   1   0.0 0.0 0.13477, 0.13477 -0.14
CC028/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.48
CC028/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC029/UncJ m 0.00987531 0.0   1   0.0 0.0 0.00987531, 0.00987531 -0.36
CC030/GeniUncJ f 0.4979 0.0   1   0.0 0.0 0.4979, 0.4979 0.69
CC030/GeniUncJ m 0.19753 0.0   1   0.0 0.0 0.19753, 0.19753 -0.02
CC033/GeniUncJ f 0.27716 0.0   1   0.0 0.0 0.27716, 0.27716 0.17
CC033/GeniUncJ m 0.24488 0.0   1   0.0 0.0 0.24488, 0.24488 0.06
CC035/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.48
CC035/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC036/UncJ f 0.11708 0.0   1   0.0 0.0 0.11708, 0.11708 -0.21
CC036/UncJ m 0.05681 0.0   1   0.0 0.0 0.05681, 0.05681 -0.28
CC040/TauUncJ f 0.08661 0.0   1   0.0 0.0 0.08661, 0.08661 -0.28
CC041/TauUncJ f 0.06929 0.0   1   0.0 0.0 0.06929, 0.06929 -0.32
CC043/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.48
CC043/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC044/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.48
CC044/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC045/GeniUncJ f 0.06229 0.0   1   0.0 0.0 0.06229, 0.06229 -0.33
CC045/GeniUncJ m 0.04026 0.0   1   0.0 0.0 0.04026, 0.04026 -0.31
CC057/UncJ f 0.63387 0.0   1   0.0 0.0 0.63387, 0.63387 1.01
CC057/UncJ m 0.45703 0.0   1   0.0 0.0 0.45703, 0.45703 0.45
CC060/UncJ f 0.00715589 0.0   1   0.0 0.0 0.00715589, 0.00715589 -0.46
CC060/UncJ m 0.00989544 0.0   1   0.0 0.0 0.00989544, 0.00989544 -0.36
CC065/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.48
CC068/TauUncJ f 0.53568 0.0   1   0.0 0.0 0.53568, 0.53568 0.78
CC068/TauUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC074/UncJ f 0.1416 0.0   1   0.0 0.0 0.1416, 0.1416 -0.15
CC075/UncJ f 0.01987 0.0   1   0.0 0.0 0.01987, 0.01987 -0.43
CC075/UncJ m 0.07934 0.0   1   0.0 0.0 0.07934, 0.07934 -0.24
CC078/TauUncJ f 0.03401 0.0   1   0.0 0.0 0.03401, 0.03401 -0.4
CC078/TauUncJ m 0.39257 0.0   1   0.0 0.0 0.39257, 0.39257 0.33
CC079/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.48
CC079/TauUncJ m 0.05325 0.0   1   0.0 0.0 0.05325, 0.05325 -0.29
CC080/TauUncJ f 0.0204 0.0   1   0.0 0.0 0.0204, 0.0204 -0.43
CC080/TauUncJ m 0.3041 0.0   1   0.0 0.0 0.3041, 0.3041 0.17
CC083/UncJ f 0.03942 0.0   1   0.0 0.0 0.03942, 0.03942 -0.39
CC083/UncJ m 0.05565 0.0   1   0.0 0.0 0.05565, 0.05565 -0.28
CC084/TauJ f 0.12746 0.0   1   0.0 0.0 0.12746, 0.12746 -0.18




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA