Project measure / variable:   Deschepper1   heart_RA_adj

ID, description, units MPD:10410   heart_RA_adj   atria weight, normalized to body weight   [mg]  right  
Data set, strains Deschepper1   inbred   13 strains     sex: both     age: 10wks
Procedure organ weights
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Deschepper1 - atria weight, normalized to body weight right



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested13 strains13 strains
Mean of the strain means0.162   mg 0.132   mg
Median of the strain means0.159   mg 0.143   mg
SD of the strain means± 0.0402 ± 0.0374
Coefficient of variation (CV)0.247 0.283
Min–max range of strain means0.0851   –   0.226   mg 0.0672   –   0.202   mg
Mean sample size per strain9.5   mice 9.8   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0581 0.0581 21.4377 < 0.0001
strain 12 0.1636 0.0136 5.0258 < 0.0001
sex:strain 12 0.1845 0.0154 5.6697 < 0.0001
Residuals 225 0.6102 0.0027


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.0851 0.021   9 0.00699 0.246 0.039, 0.11 -1.92
129S1/SvImJ m 0.104 0.0394   12 0.0114 0.378 0.059, 0.199 -0.76
A/J f 0.159 0.0361   9 0.012 0.227 0.095, 0.208 -0.09
A/J m 0.115 0.048   9 0.016 0.417 0.053, 0.212 -0.46
AKR/J f 0.134 0.0417   10 0.0132 0.311 0.079, 0.218 -0.71
AKR/J m 0.0854 0.0192   10 0.00608 0.225 0.051, 0.115 -1.25
BALB/cByJ f 0.212 0.0884   10 0.028 0.418 0.143, 0.416 1.23
BALB/cByJ m 0.15 0.0463   10 0.0146 0.309 0.079, 0.22 0.47
C3H/HeJ f 0.168 0.0335   10 0.0106 0.2 0.113, 0.22 0.14
C3H/HeJ m 0.148 0.0372   10 0.0118 0.251 0.09, 0.222 0.42
C57BL/6J f 0.142 0.0613   8 0.0217 0.432 0.054, 0.222 -0.51
C57BL/6J m 0.176 0.0464   10 0.0147 0.263 0.123, 0.271 1.17
C57L/J f 0.154 0.0465   10 0.0147 0.302 0.071, 0.212 -0.21
C57L/J m 0.138 0.049   10 0.0155 0.355 0.092, 0.242 0.15
CAST/EiJ f 0.186 0.0663   10 0.021 0.357 0.082, 0.303 0.59
CAST/EiJ m 0.149 0.0564   9 0.0188 0.378 0.041, 0.225 0.44
CBA/J f 0.206 0.0845   10 0.0267 0.41 0.064, 0.35 1.08
CBA/J m 0.143 0.0496   10 0.0157 0.347 0.074, 0.227 0.28
DBA/2J f 0.186 0.0669   8 0.0237 0.359 0.071, 0.272 0.59
DBA/2J m 0.147 0.0296   10 0.00937 0.202 0.092, 0.191 0.39
FVB/NJ f 0.122 0.0439   10 0.0139 0.359 0.062, 0.187 -1.01
FVB/NJ m 0.202 0.0742   10 0.0235 0.367 0.112, 0.353 1.86
PWK/PhJ f 0.132 0.0418   9 0.0139 0.317 0.076, 0.187 -0.76
PWK/PhJ m 0.0962 0.0251   9 0.00838 0.261 0.059, 0.133 -0.97
SJL/J f 0.226 0.0879   9 0.0293 0.389 0.077, 0.377 1.58
SJL/J m 0.0672 0.0223   10 0.00704 0.331 0.041, 0.101 -1.74


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.0851 0.0174 0.1193 0.0509
129S1/SvImJ m 0.1042 0.015 0.1338 0.0745
A/J f 0.1591 0.0174 0.1933 0.1249
A/J m 0.1152 0.0174 0.1494 0.081
AKR/J f 0.1339 0.0165 0.1664 0.1014
AKR/J m 0.0854 0.0165 0.1179 0.0529
BALB/cByJ f 0.2118 0.0165 0.2443 0.1793
BALB/cByJ m 0.1498 0.0165 0.1823 0.1173
C3H/HeJ f 0.1675 0.0165 0.2 0.135
C3H/HeJ m 0.1484 0.0165 0.1809 0.1159
C57BL/6J f 0.142 0.0184 0.1783 0.1057
C57BL/6J m 0.1762 0.0165 0.2087 0.1437
C57L/J f 0.1537 0.0165 0.1862 0.1212
C57L/J m 0.1381 0.0165 0.1706 0.1056
CAST/EiJ f 0.1857 0.0165 0.2182 0.1532
CAST/EiJ m 0.1492 0.0174 0.1834 0.115
CBA/J f 0.206 0.0165 0.2385 0.1735
CBA/J m 0.1428 0.0165 0.1753 0.1103
DBA/2J f 0.1864 0.0184 0.2227 0.1501
DBA/2J m 0.1468 0.0165 0.1793 0.1143
FVB/NJ f 0.1224 0.0165 0.1549 0.0899
FVB/NJ m 0.202 0.0165 0.2345 0.1695
PWK/PhJ f 0.1318 0.0174 0.166 0.0976
PWK/PhJ m 0.0962 0.0174 0.1304 0.062
SJL/J f 0.2257 0.0174 0.2599 0.1915
SJL/J m 0.0672 0.0165 0.0997 0.0347


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.0946 0.0115 0.1173 0.072
A/J both 0.1372 0.0123 0.1614 0.113
AKR/J both 0.1096 0.0116 0.1326 0.0867
BALB/cByJ both 0.1808 0.0116 0.2037 0.1579
C3H/HeJ both 0.1579 0.0116 0.1809 0.135
C57BL/6J both 0.1591 0.0124 0.1834 0.1348
C57L/J both 0.1459 0.0116 0.1688 0.123
CAST/EiJ both 0.1675 0.012 0.191 0.1439
CBA/J both 0.1744 0.0116 0.1973 0.1515
DBA/2J both 0.1666 0.0124 0.1909 0.1422
FVB/NJ both 0.1622 0.0116 0.1851 0.1393
PWK/PhJ both 0.114 0.0123 0.1382 0.0898
SJL/J both 0.1464 0.012 0.17 0.1229




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS