Project measure / variable:   Peters4   MONO_M12

ID, description, units MPD:24318   MONO_M12   monocyte count (MONO; units per volume x 103)   [n/µL]  at age 12mo  
Data set, strains Peters4   inbred   30 strains     sex: both     age: 52wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Peters4 - monocyte count (MONO; units per volume x 103) at age 12mo



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested30 strains30 strains
Mean of the strain means0.195   n/µL 0.239   n/µL
Median of the strain means0.186   n/µL 0.207   n/µL
SD of the strain means± 0.0870 ± 0.0932
Coefficient of variation (CV)0.446 0.390
Min–max range of strain means0.0763   –   0.381   n/µL 0.123   –   0.458   n/µL
Mean sample size per strain7.7   mice 7.4   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.2127 0.2127 37.1914 < 0.0001
strain 29 3.0195 0.1041 18.2056 < 0.0001
sex:strain 29 0.5882 0.0203 3.5464 < 0.0001
Residuals 392 2.2419 0.0057


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.129 0.0259   8 0.00915 0.201 0.09, 0.17 -0.76
129S1/SvImJ m 0.173 0.132   7 0.05 0.766 0.07, 0.39 -0.71
A/J f 0.186 0.066   7 0.025 0.356 0.09, 0.28 -0.1
A/J m 0.28 0.158   6 0.0645 0.564 0.13, 0.53 0.44
BALB/cByJ f 0.184 0.0695   7 0.0263 0.377 0.08, 0.29 -0.13
BALB/cByJ m 0.343 0.0602   7 0.0228 0.176 0.29, 0.44 1.12
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.287 0.0492   8 0.0174 0.171 0.24, 0.4 1.06
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.375 0.102   8 0.036 0.271 0.27, 0.59 1.46
BUB/BnJ f 0.113 0.034   7 0.0129 0.301 0.07, 0.17 -0.94
BUB/BnJ m 0.132 0.0665   6 0.0271 0.505 0.08, 0.26 -1.15
C3H/HeJ f 0.19 0.0499   8 0.0176 0.262 0.13, 0.29 -0.06
C3H/HeJ m 0.216 0.0767   8 0.0271 0.355 0.12, 0.33 -0.24
C57BL/10J f 0.21 0.0675   9 0.0225 0.321 0.12, 0.33 0.17
C57BL/10J m 0.195 0.0652   8 0.0231 0.335 0.08, 0.28 -0.47
C57BL/6J f 0.114 0.0465   7 0.0176 0.407 0.05, 0.17 -0.93
C57BL/6J m 0.157 0.0344   6 0.0141 0.22 0.09, 0.19 -0.88
C57BLKS/J f 0.381 0.108   8 0.0382 0.284 0.21, 0.51 2.14
C57BLKS/J m 0.309 0.0445   8 0.0157 0.144 0.24, 0.37 0.75
C57BR/cdJ f 0.239 0.0398   8 0.0141 0.167 0.18, 0.31 0.51
C57BR/cdJ m 0.232 0.0212   8 0.0075 0.0912 0.21, 0.26 -0.07
C57L/J f 0.13 0.0278   8 0.00982 0.214 0.08, 0.16 -0.75
C57L/J m 0.159 0.0368   8 0.013 0.232 0.11, 0.22 -0.86
CAST/EiJ f 0.158 0.0863   8 0.0305 0.548 0.08, 0.3 -0.43
CAST/EiJ m 0.173 0.0388   6 0.0158 0.224 0.12, 0.21 -0.71
CBA/J f 0.095 0.0414   8 0.0146 0.436 0.05, 0.15 -1.15
CBA/J m 0.224 0.0854   7 0.0323 0.381 0.1, 0.33 -0.16
DBA/2J f 0.264 0.13   8 0.0461 0.494 0.09, 0.46 0.79
DBA/2J m 0.133 0.0912   7 0.0345 0.687 0.05, 0.29 -1.13
FVB/NJ f 0.111 0.0223   8 0.00789 0.201 0.09, 0.16 -0.97
FVB/NJ m 0.15 0.0478   8 0.0169 0.319 0.06, 0.19 -0.95
KK/HlJ f 0.211 0.0414   7 0.0156 0.196 0.15, 0.26 0.18
KK/HlJ m 0.187 0.0537   11 0.0162 0.287 0.12, 0.26 -0.56
LP/J f 0.349 0.12   8 0.0425 0.345 0.24, 0.56 1.77
LP/J m 0.399 0.0478   7 0.0181 0.12 0.31, 0.45 1.72
MRL/MpJ f 0.124 0.0479   7 0.0181 0.385 0.05, 0.2 -0.82
MRL/MpJ m 0.198 0.0345   8 0.0122 0.175 0.15, 0.26 -0.44
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.309 0.11   8 0.0389 0.356 0.19, 0.52 1.31
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.458 0.115   8 0.0407 0.251 0.29, 0.6 2.35
NON/ShiLtJ f 0.322 0.0848   9 0.0283 0.263 0.2, 0.46 1.46
NON/ShiLtJ m 0.324 0.103   7 0.039 0.318 0.17, 0.46 0.91
NZO/HlLtJ f 0.187 0.0339   6 0.0138 0.181 0.15, 0.23 -0.09
NZO/HlLtJ m 0.276 0.077   5 0.0344 0.279 0.19, 0.37 0.4
NZW/LacJ f 0.319 0.0846   8 0.0299 0.265 0.22, 0.49 1.42
NZW/LacJ m 0.386 0.1   8 0.0355 0.26 0.27, 0.56 1.58
P/J f 0.0871 0.0243   7 0.00918 0.279 0.06, 0.13 -1.24
P/J m 0.193 0.104   3 0.0601 0.538 0.11, 0.31 -0.49
PL/J f 0.307 0.0799   7 0.0302 0.26 0.18, 0.44 1.29
PL/J m 0.271 0.0686   9 0.0229 0.253 0.12, 0.37 0.35
PWD/PhJ f 0.105 0.0389   8 0.0138 0.371 0.07, 0.18 -1.03
PWD/PhJ m 0.296 0.176   8 0.0621 0.593 0.15, 0.7 0.61
RIIIS/J f 0.0763 0.013   8 0.0046 0.171 0.06, 0.1 -1.36
RIIIS/J m 0.123 0.039   7 0.0148 0.318 0.07, 0.19 -1.24
SJL/J f 0.101 0.0564   7 0.0213 0.556 0.04, 0.18 -1.08
SJL/J m 0.126 0.0684   8 0.0242 0.542 0.05, 0.26 -1.21
SM/J f 0.189 0.0544   8 0.0192 0.288 0.13, 0.28 -0.07
SM/J m 0.196 0.0894   8 0.0316 0.456 0.1, 0.39 -0.46
SWR/J f 0.197 0.0624   7 0.0236 0.316 0.09, 0.26 0.02
SWR/J m 0.144 0.0686   8 0.0243 0.478 0.08, 0.27 -1.02
WSB/EiJ f 0.177 0.0527   9 0.0176 0.298 0.08, 0.28 -0.21
WSB/EiJ m 0.335 0.0999   8 0.0353 0.298 0.18, 0.48 1.03


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.1287 0.0267 0.1813 0.0762
129S1/SvImJ m 0.1729 0.0286 0.2291 0.1167
A/J f 0.1857 0.0286 0.2419 0.1295
A/J m 0.28 0.0309 0.3407 0.2193
BALB/cByJ f 0.1843 0.0286 0.2405 0.1281
BALB/cByJ m 0.3429 0.0286 0.3991 0.2867
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.2875 0.0267 0.3401 0.2349
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.375 0.0267 0.4276 0.3224
BUB/BnJ f 0.1129 0.0286 0.1691 0.0567
BUB/BnJ m 0.1317 0.0309 0.1924 0.071
C3H/HeJ f 0.19 0.0267 0.2426 0.1374
C3H/HeJ m 0.2163 0.0267 0.2688 0.1637
C57BL/10J f 0.21 0.0252 0.2596 0.1604
C57BL/10J m 0.195 0.0267 0.2476 0.1424
C57BL/6J f 0.1143 0.0286 0.1705 0.0581
C57BL/6J m 0.1567 0.0309 0.2174 0.096
C57BLKS/J f 0.3812 0.0267 0.4338 0.3287
C57BLKS/J m 0.3087 0.0267 0.3613 0.2562
C57BR/cdJ f 0.2387 0.0267 0.2913 0.1862
C57BR/cdJ m 0.2325 0.0267 0.2851 0.1799
C57L/J f 0.13 0.0267 0.1826 0.0774
C57L/J m 0.1587 0.0267 0.2113 0.1062
CAST/EiJ f 0.1575 0.0267 0.2101 0.1049
CAST/EiJ m 0.1733 0.0309 0.234 0.1126
CBA/J f 0.095 0.0267 0.1476 0.0424
CBA/J m 0.2243 0.0286 0.2805 0.1681
DBA/2J f 0.2637 0.0267 0.3163 0.2112
DBA/2J m 0.1329 0.0286 0.1891 0.0767
FVB/NJ f 0.1112 0.0267 0.1638 0.0587
FVB/NJ m 0.15 0.0267 0.2026 0.0974
KK/HlJ f 0.2114 0.0286 0.2676 0.1552
KK/HlJ m 0.1873 0.0228 0.2321 0.1424
LP/J f 0.3487 0.0267 0.4013 0.2962
LP/J m 0.3986 0.0286 0.4548 0.3424
MRL/MpJ f 0.1243 0.0286 0.1805 0.0681
MRL/MpJ m 0.1975 0.0267 0.2501 0.1449
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.3087 0.0267 0.3613 0.2562
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.4575 0.0267 0.5101 0.4049
NON/ShiLtJ f 0.3222 0.0252 0.3718 0.2727
NON/ShiLtJ m 0.3243 0.0286 0.3805 0.2681
NZO/HlLtJ f 0.1867 0.0309 0.2474 0.126
NZO/HlLtJ m 0.276 0.0338 0.3425 0.2095
NZW/LacJ f 0.3187 0.0267 0.3713 0.2662
NZW/LacJ m 0.3862 0.0267 0.4388 0.3337
P/J f 0.0871 0.0286 0.1433 0.0309
P/J m 0.1933 0.0437 0.2792 0.1075
PL/J f 0.3071 0.0286 0.3633 0.2509
PL/J m 0.2711 0.0252 0.3207 0.2216
PWD/PhJ f 0.105 0.0267 0.1576 0.0524
PWD/PhJ m 0.2963 0.0267 0.3488 0.2437
RIIIS/J f 0.0762 0.0267 0.1288 0.0237
RIIIS/J m 0.1229 0.0286 0.1791 0.0667
SJL/J f 0.1014 0.0286 0.1576 0.0452
SJL/J m 0.1263 0.0267 0.1788 0.0737
SM/J f 0.1887 0.0267 0.2413 0.1362
SM/J m 0.1962 0.0267 0.2488 0.1437
SWR/J f 0.1971 0.0286 0.2533 0.1409
SWR/J m 0.1437 0.0267 0.1963 0.0912
WSB/EiJ f 0.1767 0.0252 0.2262 0.1271
WSB/EiJ m 0.335 0.0267 0.3876 0.2824


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.1508 0.0196 0.1893 0.1123
A/J both 0.2329 0.021 0.2742 0.1915
BALB/cByJ both 0.2636 0.0202 0.3033 0.2238
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.3312 0.0189 0.3684 0.2941
BUB/BnJ both 0.1223 0.021 0.1636 0.0809
C3H/HeJ both 0.2031 0.0189 0.2403 0.166
C57BL/10J both 0.2025 0.0184 0.2386 0.1664
C57BL/6J both 0.1355 0.021 0.1768 0.0941
C57BLKS/J both 0.345 0.0189 0.3822 0.3078
C57BR/cdJ both 0.2356 0.0189 0.2728 0.1985
C57L/J both 0.1444 0.0189 0.1815 0.1072
CAST/EiJ both 0.1654 0.0204 0.2056 0.1253
CBA/J both 0.1596 0.0196 0.1981 0.1212
DBA/2J both 0.1983 0.0196 0.2368 0.1598
FVB/NJ both 0.1306 0.0189 0.1678 0.0935
KK/HlJ both 0.1994 0.0183 0.2353 0.1634
LP/J both 0.3737 0.0196 0.4121 0.3352
MRL/MpJ both 0.1609 0.0196 0.1994 0.1224
NOD.B10Sn-H2b/J both 0.3831 0.0189 0.4203 0.346
NON/ShiLtJ both 0.3233 0.0191 0.3607 0.2858
NZO/HlLtJ both 0.2313 0.0229 0.2763 0.1863
NZW/LacJ both 0.3525 0.0189 0.3897 0.3153
P/J both 0.1402 0.0261 0.1915 0.0889
PL/J both 0.2891 0.0191 0.3266 0.2517
PWD/PhJ both 0.2006 0.0189 0.2378 0.1635
RIIIS/J both 0.0996 0.0196 0.138 0.0611
SJL/J both 0.1138 0.0196 0.1523 0.0754
SM/J both 0.1925 0.0189 0.2297 0.1553
SWR/J both 0.1704 0.0196 0.2089 0.132
WSB/EiJ both 0.2558 0.0184 0.292 0.2197




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS