Project measure / variable:   Auwerx1   ldl_HFD

ID, description, units MPD:111367   ldl_HFD   blood LDL amount   [mmol/L]  HFD  
high-fat diet study
Data set, strains Auwerx1   BXD w/par   52 strains     sex: m     age: 29wks
Procedure lipid profile
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Auwerx1 - blood LDL amount HFD



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested52 strains
Mean of the strain means0.29008   mmol/L
Median of the strain means0.24025   mmol/L
SD of the strain means± 0.15984
Coefficient of variation (CV)0.551
Min–max range of strain means0.0825   –   0.945   mmol/L
Mean sample size per strain4.2   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 51 5.4965 0.1078 12.4309 < 0.0001
Residuals 168 1.4565 0.0087


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD1 m 0.194 0.03209   5 0.01435 0.1654 0.14, 0.22 -0.6
BXD100 m 0.334 0.11696   5 0.05231 0.3502 0.19, 0.49 0.27
BXD101 m 0.3475 0.10563   4 0.05282 0.304 0.21, 0.44 0.36
BXD16 m 0.43 0.07036   5 0.03146 0.1636 0.35, 0.53 0.88
BXD27 m 0.305 0.18484   4 0.09242 0.606 0.16, 0.57 0.09
BXD32 m 0.24667 0.05686   3 0.03283 0.2305 0.2, 0.31 -0.27
BXD34 m 0.264 0.03578   5 0.016 0.1355 0.21, 0.3 -0.16
BXD39 m 0.644 0.08264   5 0.03696 0.1283 0.56, 0.78 2.21
BXD40 m 0.1 0.02309   4 0.01155 0.2309 0.08, 0.12 -1.19
BXD43 m 0.14 0.02   3 0.01155 0.1429 0.12, 0.16 -0.94
BXD44 m 0.128 0.14377   5 0.0643 1.1232 0.01, 0.29 -1.01
BXD45 m 0.2075 0.04787   4 0.02394 0.2307 0.14, 0.25 -0.52
BXD48 m 0.198 0.03768   5 0.01685 0.1903 0.14, 0.24 -0.58
BXD48a m 0.41667 0.06351   3 0.03667 0.1524 0.38, 0.49 0.79
BXD49 m 0.265 0.21393   4 0.10697 0.8073 0.11, 0.58 -0.16
BXD50 m 0.238 0.11411   5 0.05103 0.4794 0.16, 0.44 -0.33
BXD51 m 0.2425 0.12764   4 0.06382 0.5263 0.1, 0.36 -0.3
BXD53 m 0.524 0.11327   5 0.05066 0.2162 0.43, 0.71 1.46
BXD55 m 0.1975 0.06551   4 0.03276 0.3317 0.14, 0.28 -0.58
BXD56 m 0.23 0.0   2   0.0 0.0 0.23, 0.23 -0.38
BXD6 m 0.186 0.05177   5 0.02315 0.2783 0.14, 0.27 -0.65
BXD60 m 0.945 0.11561   4 0.05781 0.1223 0.84, 1.05 4.1
BXD61 m 0.148 0.07887   5 0.03527 0.5329 0.07, 0.27 -0.89
BXD62 m 0.395 0.09327   4 0.04664 0.2361 0.27, 0.48 0.66
BXD63 m 0.11 0.01414   2   0.01 0.1286 0.1, 0.12 -1.13
BXD64 m 0.23 0.07118   4 0.03559 0.3095 0.13, 0.29 -0.38
BXD65 m 0.57 0.08602   4 0.04301 0.1509 0.47, 0.66 1.75
BXD65a m 0.4325 0.13099   4 0.06549 0.3029 0.24, 0.52 0.89
BXD66 m 0.125 0.05447   4 0.02723 0.4357 0.08, 0.2 -1.03
BXD67 m 0.354 0.12239   5 0.05474 0.3457 0.2, 0.52 0.4
BXD68 m 0.305 0.08347   4 0.04173 0.2737 0.19, 0.39 0.09
BXD69 m 0.132 0.03564   5 0.01594 0.27 0.1, 0.19 -0.99
BXD70 m 0.32333 0.10408   3 0.06009 0.3219 0.24, 0.44 0.21
BXD71 m 0.30333 0.08327   3 0.04807 0.2745 0.21, 0.37 0.08
BXD73 m 0.1425 0.07136   4 0.03568 0.5007 0.06, 0.23 -0.92
BXD73a m 0.234 0.0532   5 0.02379 0.2273 0.16, 0.29 -0.35
BXD73b m 0.226 0.03912   5 0.01749 0.1731 0.16, 0.25 -0.4
BXD75 m 0.222 0.08319   5 0.0372 0.3747 0.13, 0.35 -0.43
BXD77 m 0.306 0.12116   5 0.05418 0.396 0.19, 0.49 0.1
BXD79 m 0.21 0.05292   5 0.02366 0.252 0.14, 0.28 -0.5
BXD81 m 0.46667 0.05508   3 0.0318 0.118 0.41, 0.52 1.1
BXD83 m 0.2125 0.07136   4 0.03568 0.3358 0.14, 0.31 -0.49
BXD84 m 0.44667 0.06429   3 0.03712 0.1439 0.4, 0.52 0.98
BXD85 m 0.2575 0.07089   4 0.03544 0.2753 0.16, 0.33 -0.2
BXD87 m 0.182 0.02588   5 0.01158 0.1422 0.15, 0.22 -0.68
BXD89 m 0.0825 0.01258   4 0.00629153 0.1525 0.07, 0.1 -1.3
BXD90 m 0.2175 0.13251   4 0.06625 0.6092 0.11, 0.41 -0.45
BXD95 m 0.395 0.18735   4 0.09367 0.4743 0.16, 0.59 0.66
BXD98 m 0.566 0.14346   5 0.06416 0.2535 0.4, 0.71 1.73
BXD99 m 0.194 0.05899   5 0.02638 0.3041 0.12, 0.24 -0.6
C57BL/6J m 0.372 0.09365   5 0.04188 0.2517 0.26, 0.5 0.51
DBA/2J m 0.14 0.03937   5 0.01761 0.2812 0.1, 0.2 -0.94


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 m 0.194 0.0416408968 0.2762068418 0.1117931582
BXD100 m 0.334 0.0416408968 0.4162068418 0.2517931582
BXD101 m 0.3475 0.0465559379 0.4394100432 0.2555899568
BXD16 m 0.43 0.0416408968 0.5122068418 0.3477931582
BXD27 m 0.305 0.0465559379 0.3969100432 0.2130899568
BXD32 m 0.2466666667 0.0537581666 0.3527952431 0.1405380903
BXD34 m 0.264 0.0416408968 0.3462068418 0.1817931582
BXD39 m 0.644 0.0416408968 0.7262068418 0.5617931582
BXD40 m 0.1 0.0465559379 0.1919100432 0.0080899568
BXD43 m 0.14 0.0537581666 0.2461285764 0.0338714236
BXD44 m 0.128 0.0416408968 0.2102068418 0.0457931582
BXD45 m 0.2075 0.0465559379 0.2994100432 0.1155899568
BXD48 m 0.198 0.0416408968 0.2802068418 0.1157931582
BXD48a m 0.4166666667 0.0537581666 0.5227952431 0.3105380903
BXD49 m 0.265 0.0465559379 0.3569100432 0.1730899568
BXD50 m 0.238 0.0416408968 0.3202068418 0.1557931582
BXD51 m 0.2425 0.0465559379 0.3344100432 0.1505899568
BXD53 m 0.524 0.0416408968 0.6062068418 0.4417931582
BXD55 m 0.1975 0.0465559379 0.2894100432 0.1055899568
BXD56 m 0.23 0.0658400388 0.3599804297 0.1000195703
BXD6 m 0.186 0.0416408968 0.2682068418 0.1037931582
BXD60 m 0.945 0.0465559379 1.0369100432 0.8530899568
BXD61 m 0.148 0.0416408968 0.2302068418 0.0657931582
BXD62 m 0.395 0.0465559379 0.4869100432 0.3030899568
BXD63 m 0.11 0.0658400388 0.2399804297 -0.0199804297
BXD64 m 0.23 0.0465559379 0.3219100432 0.1380899568
BXD65 m 0.57 0.0465559379 0.6619100432 0.4780899568
BXD65a m 0.4325 0.0465559379 0.5244100432 0.3405899568
BXD66 m 0.125 0.0465559379 0.2169100432 0.0330899568
BXD67 m 0.354 0.0416408968 0.4362068418 0.2717931582
BXD68 m 0.305 0.0465559379 0.3969100432 0.2130899568
BXD69 m 0.132 0.0416408968 0.2142068418 0.0497931582
BXD70 m 0.3233333333 0.0537581666 0.4294619097 0.2172047569
BXD71 m 0.3033333333 0.0537581666 0.4094619097 0.1972047569
BXD73 m 0.1425 0.0465559379 0.2344100432 0.0505899568
BXD73a m 0.234 0.0416408968 0.3162068418 0.1517931582
BXD73b m 0.226 0.0416408968 0.3082068418 0.1437931582
BXD75 m 0.222 0.0416408968 0.3042068418 0.1397931582
BXD77 m 0.306 0.0416408968 0.3882068418 0.2237931582
BXD79 m 0.21 0.0416408968 0.2922068418 0.1277931582
BXD81 m 0.4666666667 0.0537581666 0.5727952431 0.3605380903
BXD83 m 0.2125 0.0465559379 0.3044100432 0.1205899568
BXD84 m 0.4466666667 0.0537581666 0.5527952431 0.3405380903
BXD85 m 0.2575 0.0465559379 0.3494100432 0.1655899568
BXD87 m 0.182 0.0416408968 0.2642068418 0.0997931582
BXD89 m 0.0825 0.0465559379 0.1744100432 -0.0094100432
BXD90 m 0.2175 0.0465559379 0.3094100432 0.1255899568
BXD95 m 0.395 0.0465559379 0.4869100432 0.3030899568
BXD98 m 0.566 0.0416408968 0.6482068418 0.4837931582
BXD99 m 0.194 0.0416408968 0.2762068418 0.1117931582
C57BL/6J m 0.372 0.0416408968 0.4542068418 0.2897931582
DBA/2J m 0.14 0.0416408968 0.2222068418 0.0577931582




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS